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[新手求助] 带正电分子结构优化问题

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各位老师好,我在优化图中带正电分子结构,关键词# opt B3LYP/6-31+g(d)  8核8G内存,超过24小时都没算完,只能手动终止。即便参考http://sobereva.com/164帖子中添加关键词opt(gdiis,maxstep=4,notrust),或者添加溶剂scrf=iefcpm, 也没有改善。我之前从来没有遇到这重情况,忙活了一星期毫无进展,可能是非中性分子引起,请各位解惑。

crystal violet.png (108.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 36)

crystal violet 结构

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发表于 Post on 2017-9-8 02:14:49 | 只看该作者 Only view this author
这和带不带电没什么关系,和对称性有关。之前观察到高对称性的物种容易陷入奇怪的震荡。可以用opt=cartesian试试,或者破坏 or 构筑初猜的对称性分别尝试(仅依据我有限的经历,不一定普适)。(实际上这些在164里都说了)

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发表于 Post on 2017-9-8 04:09:14 | 只看该作者 Only view this author
和带不带电毫无关系

你这体系明显有C3对称性,看看当前是什么点群,如果不是C3,在gv里对称化成C3再优化,比起不用对称性时候快得多也通常更容易收敛,仔细看我博文里第7点。但如果之后发现有虚频,再按照虚频破坏对称性继续优化。

本来帖子里就没说加了溶剂模型就更容易收敛,这样做还白多花时间,不收敛的可能性甚至更高。

当前加弥散函数纯属瞎捣乱白浪费巨额计算时间,对结果还没有一丁点改善,仔细看此文了解什么时候才需要加弥散
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-8 07:08:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-8 04:09
和带不带电毫无关系

你这体系明显有C3对称性,看看当前是什么点群,如果不是C3,在gv里对称化成C3再优化 ...

谢谢卢老师解答和建议,加弥散主要是后期需要计算激发态,来保持基组一致。但自己也确实一知半解,以后一定注意。
加了C3点群之后,很快就得到优化的结构了,非常感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-8 07:09:15 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-9-8 02:14
这和带不带电没什么关系,和对称性有关。之前观察到高对称性的物种容易陷入奇怪的震荡。可以用opt=cartesia ...

谢谢李老师,GView加了C3对称之后,很快收敛了,谢谢您的提醒!

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发表于 Post on 2017-9-8 07:42:03 | 只看该作者 Only view this author
beidiwu 发表于 2017-9-8 07:08
谢谢卢老师解答和建议,加弥散主要是后期需要计算激发态,来保持基组一致。但自己也确实一知半解,以后一 ...


算电子激发根本用不着和几何优化的级别一致,保持这种一致完全是多余,完全白浪费时间
这种分子算激发态也根本没必要加弥散

激发态用的基组问题这里说了
乱谈激发态的计算方法
http://sobereva.com/265

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-8 09:10:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-8 07:42
算电子激发根本用不着和几何优化的级别一致,保持这种一致完全是多余,完全白浪费时间
这种分子算激发 ...

谢谢卢老师。因为我课题偏实验,仅有计算化学积累全部是从您的博文,论坛和培训里自学来的,可能理解不够深不够全面,所以总出低级错误,以后尽量避免。
谢谢!

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