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[综合交流] 关于sob-MECP计算问题的咨询,谢谢指点

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楼主
利用sob-MECP寻找S1-T2的交叉点,最后runMECP,看着也正常结束了,但是执行到了99步,然后ReportFile中能量都一样。比如说:

Energy of First State:    -2219.5971489500
Energy of Second State:   -2219.5971489500

Convergence Check (Actual Value, then Threshold, then Status):
Max Gradient El.:   0.052833 (0.000700)   NO
RMS Gradient El.:   0.008798 (0.000500)   NO
Max Change of X:    0.036983 (0.004000)   NO
RMS Change of X:    0.006158 (0.002500)   NO
Difference in E:    0.000000 (0.000050)  YES

但是我看例子中的,都是能量最后才几乎接近。我这里ReportFile中的能量时刻都是一样的。然后最后99步才说收敛,我猜,是我是我哪里弄错了?输入文件还是什么?
谢谢老师指点
具体的计算输出的文件我已经上传,请查看,谢谢

Job99_A.log

91.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

Job99_B.log

91.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 9

ReportFile

1.85 MB, 下载次数 Times of downloads: 14

ab_initio

8.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

extract_energy

59 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4

extract_gradient

193 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 2

geom

4.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

ReportFile

1.85 MB, 下载次数 Times of downloads: 11

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发表于 Post on 2017-9-18 11:30:46 | 只看该作者 Only view this author
应该是脚本对数据解析得不对。不知道为什么你的A计算用TD,B计算用TDA。你看看reportfile里解析出来的能量到底对应于输出文件里的哪项,如果有误可以自行改改脚本。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-18 15:09:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-18 11:30
应该是脚本对数据解析得不对。不知道为什么你的A计算用TD,B计算用TDA。你看看reportfile里解析出来的能量 ...

谢谢sob老师,因为我计算单重态用的td,三重态用的tda。
我查阅了这个reportfile中的能量,对应的是高斯计算log输出文件中文件最后HF=.....这块能量。也就是基态势能面上的能量呗,所以,计算出来reportfile中两个能量一直一样。
老师说的“如果有误可以自行改改脚本。”修改哪个脚本呢?如何修改呢?谢谢老师指点
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发表于 Post on 2017-9-18 19:34:35 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2017-9-18 15:09
谢谢sob老师,因为我计算单重态用的td,三重态用的tda。
我查阅了这个reportfile中的能量,对应的是高斯 ...

sobMECP源码没多少,仔细看一遍就知道了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-18 20:24:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-18 19:34
sobMECP源码没多少,仔细看一遍就知道了

恩,好的,谢谢sob老师
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发表于 Post on 2017-11-18 21:11:36 | 只看该作者 Only view this author
可能是Gaussian版本的问题。据测试,用G09.A做DFT正常,一旦用到TDDFT,结构/能量就固定不变。G09.D,G09.E没有这个问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-11-19 07:31:15 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2017-11-18 21:11
可能是Gaussian版本的问题。据测试,用G09.A做DFT正常,一旦用到TDDFT,结构/能量就固定不变。G09.D,G09.E ...

偶,还有这一点,谢谢beefly大神指点。
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发表于 Post on 2023-10-31 21:25:42 | 只看该作者 Only view this author
需要新建一个读取TD文件能量的脚本,比如取名为extract energyTD,仿造原来读取能量文件的格式,修改为读取TD计算的激发态能量,同时要修改sub_script,调用对应的extract energyTD文件。

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