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楼主 Author: kjxwl3
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[综合交流] 现在有没有水合质子的力场?

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发表于 Post on 2017-9-28 13:43:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fhh2626 于 2017-9-28 13:48 编辑
winterzen 发表于 2017-9-28 13:37
我不记得geo文件里面有weight数值,weight一般写在trainset.in里面,误差公式一般为:

σ是权重,Reax ...

脑抽说错了,是trainset.in文件

σ是权重的倒数吧

"where Xi,t and Xi,ReaxFF are the target quantum mechanical/experimental and ReaxFF values of the ith entry of the training set and σi the inverse weight that determines how accurately the data needs to be fitted with the QM/experimental data."

奇怪,图片不管怎么传长宽比都会变

QQ截图20170928134609.jpg (66.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 63)

QQ截图20170928134609.jpg

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发表于 Post on 2017-9-28 13:53:28 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2017-9-28 13:43
脑抽说错了,是trainset.in文件

σ是权重的倒数吧

论文中这句话的表述容易引起误解,实际上他们拟合程序中的weight就是公式里的σ。
见原始手册第38页:
http://www.wag.caltech.edu/home/duin/reax_um.pdf

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发表于 Post on 2017-9-28 14:03:21 | 只看该作者 Only view this author
winterzen 发表于 2017-9-28 13:53
论文中这句话的表述容易引起误解,实际上他们拟合程序中的weight就是公式里的σ。
见原始手册第38页:
...

厉害,感谢指正,这样的话training set就可以理解得多了

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发表于 Post on 2020-6-26 02:41:11 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2017-9-25 09:58
非常感谢,我发邮件找van Duin要训练集试试,之前我在他们的官网上提交过申请,但是没有回应
...

请问你们这个CHOLi.ff的力场文件都是从哪里找的?我刚开始接触反应力场。发现有些力场文件直接在paper的supporting material里。但是这篇paper里没有给出力场的参数。请问你们都是从哪里找的呀?谢谢啦!

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发表于 Post on 2020-6-26 09:15:09 | 只看该作者 Only view this author
lchdonkey 发表于 2020-6-26 02:41
请问你们这个CHOLi.ff的力场文件都是从哪里找的?我刚开始接触反应力场。发现有些力场文件直接在paper的s ...

你下个ADF测试版,所有已发表的ReaxFF都在里面,拷出来用就行了

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发表于 Post on 2020-8-21 08:51:27 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2020-6-26 09:15
你下个ADF测试版,所有已发表的ReaxFF都在里面,拷出来用就行了

您好,可否能给个ADF势函数文件的百度云链接,他们的客服一直加不上。。

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发表于 Post on 2020-8-21 11:14:54 | 只看该作者 Only view this author
zxs1127 发表于 2020-8-21 08:51
您好,可否能给个ADF势函数文件的百度云链接,他们的客服一直加不上。。

直接在ADF官网上下个安装包不就行了

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发表于 Post on 2020-8-21 11:51:57 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2020-8-21 11:14
直接在ADF官网上下个安装包不就行了

好的,谢谢,我试试

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发表于 Post on 2020-8-21 12:07:00 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2020-8-21 11:14
直接在ADF官网上下个安装包不就行了

不行呀,他这个下载要登陆账号,还没有注册的地方。。。

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发表于 Post on 2022-3-27 11:49:14 | 只看该作者 Only view this author
您好,我在‘ReaxFF Parameter Optimization with Monte-Carlo and Evolutionary Algorithms: Guidelines and Insights‘ (https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jctc.9b00769)一文中看到他们用DFT计算+蒙卡优化,想请问下这样的优化reaxff方式是否比训练机器学习势再计算力场要成本低些呢?

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发表于 Post on 2023-3-28 21:25:01 | 只看该作者 Only view this author
winterzen 发表于 2017-9-25 00:35
我不熟悉Li电池体系,粗略看了一下文章,以下是一点个人的观点:

CHOLi.ff这个力场的原始文献(J. Che ...

你好,请问力场参数优化的trainset.in 和 geo的是自动制备的吗?最近发现https://github.com/cagrikymk/JAX-ReaxFF   这个库虽然很大程度降低了优化ReaxFF参数的难度,但是特别好奇怎么才能得到自己想要研究的体系的trainset.in 和 geo 这两个文件。

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