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[新手求助] 如何进行ESR顺磁谱图的模拟?

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找了一些这方面的文献,但是基本没有详细说明用的什么软件或者是什么基组什么的,有没有哪位大神做过这方面的模拟,提供一下资源或方法,不胜感激?

TIM截图20171017144650.png (27.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 114)

ESR

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发表于 Post on 2017-10-17 15:05:25 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2017-10-17 19:36:55 | 只看该作者 Only view this author
用高斯:基组使用EPR-N系列能够较好描述核处电子密度的基组,一般的泛函。用高斯计算各核的何处自旋密度(什么都不用写就会输出),计算出后乘以对应原子核的特定常数即可

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-17 21:34:55 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-10-17 19:36
用高斯:基组使用EPR-N系列能够较好描述核处电子密度的基组,一般的泛函。用高斯计算各核的何处自旋密度( ...

“对应原子核的特定常数”是指的哪个常数啊?

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发表于 Post on 2017-10-17 22:14:46 | 只看该作者 Only view this author
计算超精细耦合在exploring第三版里就有例子
如果是要计算ESR谱图,用easyspin结合ORCA
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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发表于 Post on 2017-10-17 22:32:40 | 只看该作者 Only view this author
nnzhang 发表于 2017-10-17 21:34
“对应原子核的特定常数”是指的哪个常数啊?

参看例如
J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3174-3181
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-17 22:48:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-17 22:14
计算超精细耦合在exploring第三版里就有例子
如果是要计算ESR谱图,用easyspin结合ORCA

嗯嗯  谢谢老师!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-17 22:49:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-17 22:32
参看例如
J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3174-3181

好的老师

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发表于 Post on 2018-4-1 17:42:42 | 只看该作者 Only view this author
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-10 11:21:15 | 只看该作者 Only view this author
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

在用matlab结合easyspin进行谱图模拟的时候,原子数大于20个后就计算很慢很慢,这个是什么原因呢?有没有什么解决办法呢?

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发表于 Post on 2020-7-1 17:57:04 | 只看该作者 Only view this author
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

请问我要怎么做电子顺磁计算,今天刚装了一个ORCA,我要使用什么基组和关键词

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发表于 Post on 2021-1-4 11:26:29 | 只看该作者 Only view this author
dana19851128 发表于 2018-4-1 17:42
我是做电子顺磁计算的 有什么问题?

通过实验电子自旋共振可以定性测出实验中产生自由基的类别,比如有DMPO-OH,DMPO-SO4.-。想问一下可以模拟计算DMPO-OH,DMPO-SO4.-的EPR谱图吗?这样的话实验和计算可以吻合,同时证明一下,确实是羟基自由基和硫酸根自由基。可以计算吗?如果可以的话,请问是怎么做呢?

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发表于 Post on 2021-1-4 17:25:49 | 只看该作者 Only view this author
fond 发表于 2021-1-4 11:26
通过实验电子自旋共振可以定性测出实验中产生自由基的类别,比如有DMPO-OH,DMPO-SO4.-。想问一下可以模 ...

可以,但没必要。这种自由基,尤其是DMPO-OH肯定有文献的实验谱图,跟实验比是更加靠谱的,没必要做计算。如果捕捉了一个比较奇怪的自由基,比如什么金属自由基、簇合物自由基之类的,那还值得算一下。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2023-5-18 15:47:29 | 只看该作者 Only view this author
nnzhang 发表于 2018-5-10 11:21
在用matlab结合easyspin进行谱图模拟的时候,原子数大于20个后就计算很慢很慢,这个是什么原因呢?有没有 ...

是很慢,慢到我以为是软件卡死了。你有解决方法吗?

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发表于 Post on 2023-5-18 18:31:08 | 只看该作者 Only view this author
自由风 发表于 2023-5-18 08:47
是很慢,慢到我以为是软件卡死了。你有解决方法吗?

手动删掉那些很小的、你不用计算就知道不会对谱图有显著影响的A值,再算。easyspin计算慢一般都是因为考虑了太多核的A值,实际上很多核的A值很小或者可以用展宽(lwpp)等效代替,没必要在计算中显式考虑。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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