如何进行ESR顺磁谱图的模拟？

自由风 · 发表于 Post on 2023-5-19 15:35:19

wzkchem5 发表于 2023-5-18 18:31
手动删掉那些很小的、你不用计算就知道不会对谱图有显著影响的A值，再算。easyspin计算慢一般都是因为考 ...

我算的A值大的有130，小的有15，最小的只有个位数。那手动删除的话15左右的算小吗？大小是指的绝对值吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-19 16:17:14

自由风发表于 2023-5-19 08:35
我算的A值大的有130，小的有15，最小的只有个位数。那手动删除的话15左右的算小吗？大小是指的绝对值吗？

结合你所用的lwpp，判断这个较小的A值有或者没有会不会显著影响峰形。最简单的方法是，另模拟一个只有一个A值的信号，其A值等于比如说15，lwpp和你当前模拟相同。然后看看去掉这个A值会不会显著影响峰形

wangzhe · 发表于 Post on 2023-5-19 16:17:19

之前用ORCA计算的时候用BP/EPR-II计算的结果和实验值最为吻合，不过应该是case by case，仅供参考。

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2023-6-13 10:24:20

考虑的原子数太多Matlab也会崩掉，我的建议是先把自旋密度图画出来，然后根据自旋密度分布大的位置，去选择计算那些磁性核。总的来说条件就是：磁性核、该磁性核周围自旋密度大

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2023-7-6 16:23:40

wangzhe 发表于 2023-5-19 16:17
之前用ORCA计算的时候用BP/EPR-II计算的结果和实验值最为吻合，不过应该是case by case，仅供参考。

是BP86吗？

wangzhe · 发表于 Post on 2023-7-6 16:49:21

QuantumicGuy 发表于 2023-7-6 17:23
是BP86吗？

BP86和BP计算的D和E张量结果是一样的。不知道这两个是否是同一个泛函。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-7-6 17:19:52

wangzhe 发表于 2023-7-6 09:49
BP86和BP计算的D和E张量结果是一样的。不知道这两个是否是同一个泛函。

是一个泛函

wangzhe · 发表于 Post on 2023-7-6 17:27:22

wzkchem5 发表于 2023-7-6 18:19
是一个泛函

感谢

青花 · 发表于 Post on 2024-12-4 17:20:45

请问一下老师们，用orca+easyspin模拟EPR曲线，可以把数据导出用origin作图吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-4 18:04:57

青花发表于 2024-12-4 10:20
请问一下老师们，用orca+easyspin模拟EPR曲线，可以把数据导出用origin作图吗

可以，matlab有一个函数叫做dlmwrite，可以把matlab里的任意向量或矩阵导出成csv格式，具体在matlab帮助窗口里搜

青花 · 发表于 Post on 2024-12-4 18:36:04

wzkchem5 发表于 2024-12-4 18:04
可以，matlab有一个函数叫做dlmwrite，可以把matlab里的任意向量或矩阵导出成csv格式，具体在matlab帮助 ...

谢谢老师，成功导出了。我看之前楼里之前的回复，可不可以理解为H数量过大时，允许增大lwpp（比如lwpp=1 → lwpp=2）用于抵消一部分未计算的较小A值的峰。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-4 18:39:42

青花发表于 2024-12-4 11:36
谢谢老师，成功导出了。我看之前楼里之前的回复，可不可以理解为H数量过大时，允许增大lwpp（比如lwpp=1 ...

对，调节lwpp直至和实验谱图大致相符，然后明确说明这里lwpp是调出来的，不是算出来的，因此峰宽和实验相符不说明算得准

青花 · 发表于 Post on 2024-12-4 19:44:16

wzkchem5 发表于 2024-12-4 18:39
对，调节lwpp直至和实验谱图大致相符，然后明确说明这里lwpp是调出来的，不是算出来的，因此峰宽和实验相 ...

感谢，再麻烦您一下。仪器上设置的Modulation Amplitude是我们用的lwpp对吗，然后实验谱图出来之后展宽与Modulation Amplitude设定值会有一些出入，我们再以实际为准再来计算，是这样？麻烦了

wzkchem5 · 发表于 Post on 2024-12-4 20:34:38

青花发表于 2024-12-4 12:44
感谢，再麻烦您一下。仪器上设置的Modulation Amplitude是我们用的lwpp对吗，然后实验谱图出来之后展宽与 ...

不是。EPR的纵轴是EPR响应信号对磁场的导数（dX/dB，X其实是希腊字母chi），仪器测量的时候通过让B小幅度振荡，测X振荡的幅度，这样推出dX/dB，Modulation Amplitude就是B小幅度振荡的幅度。根据导数的定义知，Modulation Amplitude越小，结果的系统误差越大，但实验噪音的影响也越大（也就是随机误差越大）。Modulation Amplitude越大，lwpp越大，但Modulation Amplitude趋于零的时候lwpp不趋于0，因为自然展宽、振动展宽等等也会导致非零lwpp，Modulation Amplitude只是总展宽里面仪器展宽的那部分，甚至可能都不是仪器展宽的全部。所以lwpp没有任何理由应该接近或等于Modulation Amplitude

青花 · 发表于 Post on 2024-12-4 21:10:34

wzkchem5 发表于 2024-12-4 20:34
不是。EPR的纵轴是EPR响应信号对磁场的导数（dX/dB，X其实是希腊字母chi），仪器测量的时候通过让B小幅度 ...

太感谢了，明白了，谢谢您

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