NAMD输入求助

phantom · 发表于 Post on 2017-11-2 13:27:48

请问一下各位前辈，NAMD win怎么控制能量最小化、平衡、施加电场、最后冷却和优化的时间？我看了很长时间的教程，也没看明白各个步骤的时间控制是怎么做到的

fhh2626 · 发表于 Post on 2017-11-3 09:43:21

timestep是每一步的时间(fs)

minimize/run 是步数

两者相乘就是模拟时间

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[NAMD] NAMD输入求助