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最近计算含有弱相互作用的两个大体系在不同温度下的相对稳定性,体系有216个原子,只是CHO元素。开始时用G09算,用M062X/6-31+G*方法,基组总共有3016个基函数,用8核10GB内存算得非常慢,基本不动,所以该用ORCA计算,计算方法是BLYP D3 GCP(DFT/SVP) def2-SVP def2-SVP/J RIJCOSX,用8核计算,每个核指定4500MB,开始时很快,但是到SCF过程就非常慢,几十个小时过去了都没有任何变化,运算过程中查看了内存使用,发现每核内存只用了0.1%(一个节点是64GB)。ORCA是最新版本V3_0_3。现在有这几个问题想请教一下大家帮我看看这个什么原因造成的:
1、这个是计算体系引起的吗?我用orca计算几十个原子的体系计算的是很快的,但是超过一百五十个原子的体系(含多个过渡金属元素)就发现单点计算都很慢。
2、是环境变量没有设好吗?是在超算中心在自己的计算目录下安装orca,
# ORCA setting
export MPI_HOME=/usr/mpi/gcc/openmpi-1.6.5
export PATH=$PATH:$MPI_HOME/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MPI_HOME/lib
export orca=/share/home/hm/ORCA
export PATH=$ORCA:$PATH
3、是脚本文件的问题吗?
#BSUB -q medium
#BSUB -o %J.out
#BSUB -e %J.err
#BSUB -n 8
WORKDIR=/share/home/hm/thermo
cd $WORKDIR
/share/home/hm/ORCA/orca /share/home/hm/thermo/hl.inp > hl.out
请大拿帮忙分析一下原因,非常感谢!!!
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