计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 17751|回复 Reply: 17
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] CCSD(T,T1DIAG)/cc-pVQZ不收敛

[复制链接 Copy URL]

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
打算用CCSD来外推CBS,前几个都算好了,这个Q基组,老是不收敛错误信息是这样:
Restarting incremental Fock formation.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(UHF) =  -358.262239769     A.U. after  129 cycles
            NFock=128  Conv=0.75D-04     -V/T= 2.0015
<Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.5000 <S**2>= 0.7741 S= 0.5120
<L.S>= 0.000000000000E+00
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     0.7741,   after     0.7504
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home3/shijc/g09/l502.exe at Wed Dec 13 02:00:17 2017.
Job cpu time:       0 days 12 hours 43 minutes 29.9 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=    345 Int=      0 D2E=      0 Chk=      7 Scr=      2

总是出现下面这样的语句:
Restarting incremental Fock formation.
CoulSu:  requested number of processors reduced to:   6 ShMem   1 Linda.
请问是哪里的问题呢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112462

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2017-12-12 20:29:18 | 只看该作者 Only view this author
还是老生常谈的问题
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61
建议优先尝试用cc-pVTZ收敛的波函数当初猜。

默认情况每隔一定圈数就会做完整的Fock矩阵生成,并且重启Incremental Fock过程。你没用#P,当前碰到难收敛情况,迭代圈数非常多了,所以这个提示也出来很多遍。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

689

帖子

21

威望

5019

eV
积分
6128

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2017-12-12 23:15:33 | 只看该作者 Only view this author
这不是ccsd的问题

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-13 09:40:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-12 20:29
还是老生常谈的问题
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

嗯嗯,谢谢sob老师的答疑

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-13 09:41:06 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2017-12-12 23:15
这不是ccsd的问题

谢谢~

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-23 14:39:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-12 20:29
还是老生常谈的问题
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

sob老师,算了快1个月的任务,log文件很久没更新了,但是rwf文件还在更新。
我看了输出文件:
NORM(A)=   0.11902784D+01
T1 Diagnostic =     0.02133096
Dominant configurations:
***********************
Spin Case        I    J    A    B          Value
   ABAB          24   23   26   27       0.105255D+00
Largest amplitude= 1.05D-01
最后一行是这样的,是不是出错了?
恳请答疑。

3813

帖子

4

威望

8002

eV
积分
11895

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

7#
发表于 Post on 2017-12-23 15:15:55 | 只看该作者 Only view this author
没问题,不是报错。但是从你这计算时间来看,体系太大了,选错程序了,应该用ORCA的DLPNO-CCSD(T)来做,牺牲一点点计算精度,换取节省的大量时间。用高斯的CCSD(T)算这么大体系是作死,因为你这才刚算完CCSD,才要开始(T)部分的计算,这后面指不定还要15天,30天还是多久,更可能直接硬盘写满、内存不够,或者停个电一切回到解放前。
做大计算前,要估算计算量,超过一个月的任务,通常是不会有人做的。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1 我很赞同

查看全部评分 View all ratings

自动做多参考态计算的程序MOKIT

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-23 16:24:03 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2017-12-23 15:15
没问题,不是报错。但是从你这计算时间来看,体系太大了,选错程序了,应该用ORCA的DLPNO-CCSD(T)来做,牺 ...

10个原子,想做一个Benchmark的。。。。。
谢谢前辈,刚才简单了解了一下ORCA,我试一下ORCA这个软件,多谢前辈!

3813

帖子

4

威望

8002

eV
积分
11895

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

9#
发表于 Post on 2017-12-23 16:44:47 | 只看该作者 Only view this author
尚艳磊 发表于 2017-12-23 16:24
10个原子,想做一个Benchmark的。。。。。
谢谢前辈,刚才简单了解了一下ORCA,我试一下ORCA这个软 ...

10个原子不算大。应该最多半个月能做完的····你是不是机器资源(核数、内存)太少了哈哈哈,不能用拖拉机来算啊
自动做多参考态计算的程序MOKIT

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112462

管理员

公社社长

10#
发表于 Post on 2017-12-23 16:54:28 | 只看该作者 Only view this author
尚艳磊 发表于 2017-12-23 16:24
10个原子,想做一个Benchmark的。。。。。
谢谢前辈,刚才简单了解了一下ORCA,我试一下ORCA这个软 ...

看你用什么基组,具体什么体系。诸如10个原子的有机体系和10个全是重原子构成的体系,耗时差多了去了。用cc-pVTZ和QZ的耗时也是数个数量级的差距。
如果没经验,瞎用CCSD(T)算的话,几个月出不来一个有用的数据都有可能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-23 16:55:03 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2017-12-23 16:44
10个原子不算大。应该最多半个月能做完的····你是不是机器资源(核数、内存)太少了哈哈哈,不能用拖 ...

16个核,在集群上计算的
我看大家都说的挺快的,所以我觉得我的怎么这么慢呢

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112462

管理员

公社社长

12#
发表于 Post on 2017-12-23 16:56:07 | 只看该作者 Only view this author
尚艳磊 发表于 2017-12-23 16:55
16个核,在集群上计算的
我看大家都说的挺快的,所以我觉得我的怎么这么慢呢

和你的计算条件、具体设定、具体体系估计根本没可比性
CCSD(T)/cc-pVTZ算有机分子10个原子倒是挺快
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-23 16:59:32 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-23 16:56
和你的计算条件、具体设定、具体体系估计根本没可比性
CCSD(T)/cc-pVTZ算有机分子10个原子倒是挺快

嗯,我的是10个原子都是CHON的,CCSD(T)/cc-pVTZ倒是挺快的(我用window跑的也很快),就是不知道CCSD(T)/cc-pVQZ(集群上)怎么就很慢了

47

帖子

0

威望

478

eV
积分
525

Level 4 (黑子)

14#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-12-23 17:06:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-23 16:56
和你的计算条件、具体设定、具体体系估计根本没可比性
CCSD(T)/cc-pVTZ算有机分子10个原子倒是挺快

sob老师,我算的是双分子的反应,因为在算之前查了一下网上大家说的情况,10个个原子的有机体系,最慢也就1个月左右多。可是已经跑了一个月了还是没算完。我用的1个节点16个核。
想请教下,会不会有其他什么可能导致的原因会算的这么慢?主要是所有的CCSD(T)/cc-pVTZ倒确实挺快额。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112462

管理员

公社社长

15#
发表于 Post on 2017-12-23 17:22:45 | 只看该作者 Only view this author
尚艳磊 发表于 2017-12-23 16:59
嗯,我的是10个原子都是CHON的,CCSD(T)/cc-pVTZ倒是挺快的(我用window跑的也很快),就是不知道CCSD(T) ...


QZ和TZ的耗时有天壤之别...耗时简直就像电动车和坦克的差别
死活非要用QZ,用ORCA或Molpro,还要再快点,可以再利用F12
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 12:26 , Processed in 0.421009 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list