在Gaussian中做限制性优化的方法

zch22076027 · 发表于 Post on 2022-8-2 10:05:05

sobereva 发表于 2022-8-1 22:00
可能可以，但这没什么实际意义

好的谢谢您

heyc · 发表于 Post on 2023-2-2 18:37:27

请问老师，冗余内坐标下设置内坐标的冻结后，出现L103报错：
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad
Berny optimization.
FormGI is forming the generalized inverse of G from B-inverse, IUseBI=4.
Eigenvalue 117 is 1.06D-30 should be greater than    0.000001 Eigenvector:
                        R5       X28    R4       Y2       R6
1                   0.53262  -0.36162 0.35716 0.32032  -0.28187
                        X21    Y4       X2       Z2       Y28
1                   0.21670  -0.18506 0.15871 0.11988  -0.11589
NTrRot= 223 NTRed= 340 NAtoms= 39 NSkip= 223 IsLin=F
Error in internal coordinate system.

请问有什么解决办法吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-2-2 18:53:57

heyc 发表于 2023-2-2 11:37
请问老师，冗余内坐标下设置内坐标的冻结后，出现L103报错：
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGr ...

在http://bbs.keinsci.com/thread-4829-1-1.html里面自己搜这个报错信息

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2023-2-3 10:28:22

请问一下，对于一个 C1 点群的分子，优化的时候 opt=ModRedundant freq 然后冻住 N 个自由度，是不是得到的结构最多只有 N 个虚频？谢谢！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-2-3 15:53:28

北大-陶豫发表于 2023-2-3 03:28
请问一下，对于一个 C1 点群的分子，优化的时候 opt=ModRedundant freq 然后冻住 N 个自由度，是不是得到的 ...

不是的，例如水分子，把H-O-H键角冻结为180度，会有2个虚频

北大-陶豫 · 发表于 Post on 2023-2-3 22:26:48

wzkchem5 发表于 2023-2-3 15:53
不是的，例如水分子，把H-O-H键角冻结为180度，会有2个虚频

刚想说 “不对，我问的是 C1 点群的分子”
但又想了一下，明白你的意思了，如果是个很大很复杂的分子，把它的某个键角强行拉到 180°，那它可能仍然是 C1 点群的分子但有两个虚频。
谢谢大佬！

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-2-4 01:50:22

北大-陶豫发表于 2023-2-3 15:26
刚想说 “不对，我问的是 C1 点群的分子”
但又想了一下，明白你的意思了，如果是个很大很复杂的分子， ...

我确实看漏了C1群这个条件，不过还好不影响结论。。。

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-3-9 11:26:09

请教一下各位老师，能否通过冻结部分键长寻找TS呢？

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-9 15:31:23

糖糖糖豆9988 发表于 2023-3-9 11:26
请教一下各位老师，能否通过冻结部分键长寻找TS呢？

可以

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-3-9 16:34:15

sobereva 发表于 2023-3-9 15:31
可以

社长，其实是这样的：我想寻找图中所示的OO*基抽取邻碳H原子，但是TS优化的过程中蓝色标注的键一直断开，我就在想是否可以冻住这个键再去找TS？

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-9 17:23:35

糖糖糖豆9988 发表于 2023-3-9 16:34
社长，其实是这样的：我想寻找图中所示的OO*基抽取邻碳H原子，但是TS优化的过程中蓝色标注的键一直断开， ...

找最终的过渡态时不能冻
在测试、尝试过程中可以考虑冻住

糖糖糖豆9988 · 发表于 Post on 2023-3-9 17:28:44

sobereva 发表于 2023-3-9 17:23
找最终的过渡态时不能冻
在测试、尝试过程中可以考虑冻住

您的意思是可以试着找一找；但是还要进一步优化，因为说不定在这个优化过程中结构就又变了？

sobereva · 发表于 Post on 2023-3-9 17:33:30

糖糖糖豆9988 发表于 2023-3-9 17:28
您的意思是可以试着找一找；但是还要进一步优化，因为说不定在这个优化过程中结构就又变了？

对

咕噜咕噜 · 发表于 Post on 2023-5-18 21:27:16

想问下老师异构体优化可以采用限制性优化吗，需求是需要确保顺式异构优化完还是顺式，反式优化完还是反式

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-19 03:10:43

咕噜咕噜发表于 2023-5-18 21:27
想问下老师异构体优化可以采用限制性优化吗，需求是需要确保顺式异构优化完还是顺式，反式优化完还是反式

想多了
优化过程哪会那么容易无理由地就自发翻过去

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[Gaussian/gview] 在Gaussian中做限制性优化的方法