请选择 进入手机版 | 继续访问电脑版

计算化学公社

 找回密码
 现在注册!
查看: 506|回复: 4

[Crystal] 计算晶面上的溶剂可及面积,采用MS软件中的atom volume&surface计算?

[复制链接]

13

帖子

0

威望

41

eV
积分
54

Level 2 能力者

发表于 2018-1-11 08:49:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
各位大神,我想计算晶面上的溶剂可及面积,但是不知道具体用MS怎么操作??有人会吗

这是关于修正附着能计算

这是关于修正附着能计算

110

帖子

0

威望

526

eV
积分
636

Level 4 (黑子)

发表于 2018-1-12 11:30:10 | 显示全部楼层
Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >
越努力越幸运!

13

帖子

0

威望

41

eV
积分
54

Level 2 能力者

 楼主| 发表于 2018-1-12 12:07:35 | 显示全部楼层
xylz6188 发表于 2018-1-12 11:30
Visualizer Tools > Calculating atom volumes & surfaces > Atom Volumes & Surfaces dialog >

非常感谢,我用了该tools,计算Aacc,也就是溶剂可及表面积,这个采用tools中的atom volume&syrface的connolly surface来计算对吗?关于此则connolly 半径设置为0吗??还是用solvent task还是both task??这些参数是怎么设置的?计算晶面面积connolly半径取0?还是直接计算盒子的底面积a*b*sina?那么容积可及面积这些参数怎么取值,求教,大神

110

帖子

0

威望

526

eV
积分
636

Level 4 (黑子)

发表于 2018-1-12 14:22:03 | 显示全部楼层
caijingtao1993 发表于 2018-1-12 12:07
非常感谢,我用了该tools,计算Aacc,也就是溶剂可及表面积,这个采用tools中的atom volume&syrface的con ...

1、是;2、不能为零,至少也得默认值;3、都可以试试,取决于你的研究体系;4、参数最好的办法就是找一个相似的参考体系(有实验数据)一一测试;5、不能取0;这个,你可以试试;6、最好读一下里面的帮助

评分

参与人数 1eV +3 收起 理由
caijingtao1993 + 3 233333

查看全部评分

越努力越幸运!

13

帖子

0

威望

41

eV
积分
54

Level 2 能力者

 楼主| 发表于 2018-1-12 18:58:01 | 显示全部楼层
xylz6188 发表于 2018-1-12 14:22
1、是;2、不能为零,至少也得默认值;3、都可以试试,取决于你的研究体系;4、参数最好的办法就是找一个 ...

谢谢,幸苦了
您需要登录后才可以回帖 登录 | 现在注册!

本版积分规则

手机版|北京科音自然科学研究中心|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949-1号 )

GMT+8, 2018-7-18 03:15 , Processed in 0.208481 second(s), 27 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表