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[其它程序] 发个分子力常数拟合程序(尝鲜版)

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发表于 2018-1-18 14:18:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 beefly 于 2019-1-14 19:48 编辑

简单的计算流程:

1,用Gaussian、ORCA、等可以做振动频率计算的量子化学程序计算并保存Hessian等信息。完整的量子化学程序/数据格式列表,参见UniMoVib手册。

2,用UniMoVib程序读取上面的数据,执行简正振动模式分析,并产生数据文件。更新版本的UniMoVib程序包括源代码,可以到主页下载:https://github.com/zorkzou/UniMoVib

3,用LocalModes程序读取上面的数据,执行局域模式分析,产生分子的键长(键伸缩)、键角等的力常数。LocalModes程序尚未正式发布,这里是测试版。正式版可能会在这里发布:https://github.com/catco-smu

简单的使用方法:

1,把test\Cfour或test\Gaussian中的job.inp文件,以及job.inp中引用的数据文件(在$qcdata部分定义)复制到run.bat所在的根目录下

2,鼠标双击run.bat

3,用ue等专业的文本编辑器查看输出文件job.out



lmode-win32.zip

862.26 KB, 下载次数: 64

localmodes

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zyzhang + 5 尝鲜不够!要吃大餐!
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发表于 2018-1-18 16:13:04 | 显示全部楼层
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发表于 2018-1-19 15:52:10 | 显示全部楼层
不知道跟Compliance相比  有啥异同?

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 楼主| 发表于 2018-1-19 17:23:30 | 显示全部楼层
ggdh 发表于 2018-1-19 15:52
不知道跟Compliance相比  有啥异同?

Ka = 1/Compliance

如果你说的Compliance是Grunenberg那种计算力常数方法,参见KaFml关键词的说明

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发表于 2018-2-1 23:57:17 | 显示全部楼层
大佬好厉害

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发表于 2018-2-5 08:45:24 | 显示全部楼层
膜拜大佬,厉害了

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发表于 2018-4-20 10:40:50 | 显示全部楼层
尝试了一下,我用unimovib程序正常,用lmodes程序时报错,信息为

Error! The above dihedral angle leads to singularity!

不知道楼主有没有遇到过这样的情况?
gcq#413: "I know poetry is not dead, nor genius lost; nor has Mammon gained power over either, to bind or slay; they will both assert their existence, their presence, their liberty and strength again one day." (Jane Eyre in Jane Eyre by Charlotte Bronte)

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 楼主| 发表于 2018-4-22 19:38:56 | 显示全部楼层
qczgzly 发表于 2018-4-20 10:40
尝试了一下,我用unimovib程序正常,用lmodes程序时报错,信息为

Error! The above dihedral angle lead ...

一般是a-b-c或b-c-d的键角=180造成的

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发表于 2019-1-13 23:55:06 | 显示全部楼层
LocoMode 那个网站打不开了?什么情况啊

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 楼主| 发表于 2019-1-14 19:52:40 | 显示全部楼层
ggdh 发表于 2019-1-13 23:55
LocoMode 那个网站打不开了?什么情况啊

把网址改了。准备等文章投稿后再发布,但是其他事情太多,耽搁到现在文章也没投,两年前还因此被审稿人嘲笑过。预计今年夏天会投稿

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发表于 2019-1-15 09:47:31 | 显示全部楼层
beefly 发表于 2019-1-14 19:52
把网址改了。准备等文章投稿后再发布,但是其他事情太多,耽搁到现在文章也没投,两年前还因此被审稿人嘲 ...

。。。我也是这样。怎么能够因为发文章,耽误程序发布呢。春节放假期间写好投了!来年我们好引用

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发表于 2019-1-17 18:42:24 | 显示全部楼层
请问与QuickFF(http://molmod.github.io/QuickFF)比,有啥优点?这个软件看着挺厉害的
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