过渡态优化问题

華華 · 发表于 Post on 2018-2-4 20:46:15

各位大神，过渡态优化时，由于反应物的原子较多，优化时本来不应该反应的部分和发生反应的氧原子发生了反应，这主要是什么原因？我试了一下把反应物其中的一部分固定住，使其在优化时不与氧原子反应，这样优化氧原子的反应方向是对的，但是我不知道这样得到的结果是合理的吗？如果不合理我应该怎么解决这个问题呢？望各位不吝赐教，谢谢！！！

ysr9868 · 发表于 Post on 2018-2-5 00:14:42

我也经常遇到这种问题，我一般是用柔性扫描等方法找更精确的初猜，调整分子结构让容易反应的原子分开。

sobereva · 发表于 Post on 2018-2-5 12:15:12

找到过渡态之后，必须把之前优化的地方放开，重新继续优化，否则结果明显引入人为虚假因素。如果之后又和氧反应上了，把那个部分构象修改一下，诸如偏向另一头，看优化后什么情况
另外也可以尝试其它计算级别

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[综合交流] 过渡态优化问题

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