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[Gaussian/gview] Warnings in Gaussian frequency calculation

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发表于 2018-2-9 04:53:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在计算两条parallel reaction pathways的决速步的吉布斯自由能,想要由此预算实验上不同产物的比例,所以需要精确的吉布斯自由能。command line如下:
# opt=(calcfc,tight,ts,noeigentest) freq m06/6-311G(d,p) int=ultrafine Temperature=423.15

高斯输出文件里有两个警告(加粗处),请问这警告会多大程度影响吉布斯自由能的精确性呢?如此影响较大,该怎样修正?


    Eigenvalues --  ******************************
           X            0.99981  -0.01461   0.01301
           Y            0.01387   0.99837   0.05544
           Z           -0.01380  -0.05525   0.99838
This molecule is an asymmetric top.
Rotational symmetry number  1.
Warning -- assumption of classical behavior for rotation
           may cause significant error
Rotational temperatures (Kelvin)      0.00709     0.00467     0.00405
Rotational constants (GHZ):           0.14773     0.09724     0.08445
    1 imaginary frequencies ignored.
Zero-point vibrational energy    1222745.6 (Joules/Mol)
                                  292.24322 (Kcal/Mol)
Warning -- explicit consideration of  66 degrees of freedom as
           vibrations may cause significant error


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发表于 2018-2-9 13:49:58 | 显示全部楼层
这是提醒你,对于那些低频振动模式,当做谐振子方式考虑可能对计算的热力学量产生明显误差,改用诸如受阻转子、自由转子等方式考虑可能会得到明显改善

但一般没必要太在意这个,比如是个大分子反应,反应的地方只涉及局部很小区域,不怎么牵扯柔性区域构象变化,那么那些地方计算前后误差会充分抵消
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 楼主| 发表于 2018-2-9 23:31:55 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2018-2-9 13:49
这是提醒你,对于那些低频振动模式,当做谐振子方式考虑可能对计算的热力学量产生明显误差,改用诸如受阻转 ...

谢谢老师!
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