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[Multiwfn使用咨询] ICSS计算导入NICS结果时闪退

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楼主
老师您好,我在参照您的帖子http://sobereva.com/216绘制ICSS图,在导入NICS结果时,程序总是闪退。我仔细对照过您在帖子中的苯的例子,发现在您的例子中,settings.ini中NICSnptlim值必须为默认值8000,才能正确的导入NICS结果,否则还是会出现闪退的问题。
而我在计算中,延展设置为12Bohr,格点为low quality grid,NICSnptlim修改为2000。在高斯计算NICS过程中,multiwfn程序并未关闭(NICSnptlim的修改在multiwfn启动之前),因此不存在延展距离和格点不一致的问题及NICSnptlim值冲突的问题,但在导入NICS结果时还是发生闪退。这种情况只在我计算立体结构的时候出现,平面或伪平面结构计算时都未出现,但根据您在帖子中的描述,富勒烯之类的立体结构也是可以计算的,因此我不确定是什么原因导致的闪退。我将输入和结果文件一并发给您,希望您能给与解决,谢谢。

P8C3H6.rar (9.71 MB, 下载次数 Times of downloads: 11)


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发表于 Post on 2018-4-24 17:27:26 | 只看该作者 Only view this author
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有1999个原子(比如是否是虚原子搞鬼?)

PS:当前体系不加极化函数,ICSS的结果定性正确性难以保证,特别是对P这样的原子,没有极化函数完全没法接受。最起码得给P加上极化。而至于给氢加弥散,则是多余的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-24 20:15:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-24 17:27
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有199 ...

感谢sob老师的回复,我去确认一下是什么原因引起的原子数的差异

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-27 06:01:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-24 17:27
你的每个.out文件里只有1999个原子,不正常,按照NICSnptlim=2000来读取肯定会失败
得弄清楚为什么只有199 ...

Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他的.out文件中均包含2000个原子,但这次仍然在导入NICS结果的那一步闪退,而且从闪退前显示的导入列表看,是在NICS0075前后发生的闪退,我检查了几遍还是没发现问题。这次计算的延展设置为12Bohr,格点为自定义0.5,0.5,0.5,NICSnptlim为2000。我把所有的输入和输出文件都发给您,麻烦您再给看一下是什么问题,十分感谢。
文件大小超出附件的上限,我上传到百度网盘里了,地址在这里:
https://pan.baidu.com/s/1H0xofoSzt_EaJdDMSZntxw

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发表于 Post on 2018-4-27 18:48:44 | 只看该作者 Only view this author
drogonfly 发表于 2018-4-27 06:01
Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他 ...

你的很多任务都失败了,比如NICS0081。必须正常结束才行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-6-18 15:29:00 | 只看该作者 Only view this author
drogonfly 发表于 2018-4-27 06:01
Sob老师您好,根据您的回复我又重新提交了一遍任务,并将每个结果文件都检查了一遍;除了最后一个,其他 ...

楼主,你好!请问是如何解决原子数不符的问题的?谢谢!

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