DMol3 优化 |dR|max 结果是NO，但却显示优化成功

Channing · 发表于 Post on 2018-5-2 22:13:08

各位老师好！

我在进行Co3O4表面的吸附计算，磁性已加。在优化吸附OOH的时候遇到了以下几个问题

1. 出现了OOH键长变化很大，delta E yes；|F|max yes；|dR|max no；但最后还是显示优化成功。

2. OOH键长变化很大，delta E yes；|F|max yes；|dR|max yes。

3. OOH正常，delta E yes；|F|max yes；|dR|max no；但最后显示优化成功。

请问各位老师，这种情况该如何处理？

卡开发发 · 发表于 Post on 2018-5-3 02:45:09

本帖最后由卡开发发于 2018-5-6 22:26 编辑

你可以在优化完的结构上继续优化看看是否还有这样的问题，如果不行的话可以试试直角坐标+GDIIS，这在接近极小点附近效率很高。

Channing · 发表于 Post on 2018-5-3 15:42:09

卡开发发发表于 2018-5-3 02:45
你可以在优化完的结构上继续优化看看是否还有这样的问题，如果不行的话可以试试直角坐标+GDIIS，这在接近极 ...

好的！我试试，谢谢您！

zorow · 发表于 Post on 2018-5-6 14:39:17

我在几何优化时也见到过这种情况，感觉三项中有两项收敛了就会显示计算成功的样子

卡开发发 · 发表于 Post on 2018-5-6 16:23:27

zorow 发表于 2018-5-6 14:39
我在几何优化时也见到过这种情况，感觉三项中有两项收敛了就会显示计算成功的样子

keywords: Opt_Converge_All了解一下

zorow · 发表于 Post on 2018-5-6 20:26:11

卡开发发发表于 2018-5-6 16:23
keywords: Opt_Converge_All了解一下

这个keywords是怎么加的啊...在run files里面吗，卡开发发老师

卡开发发 · 发表于 Post on 2018-5-6 21:26:24

zorow 发表于 2018-5-6 20:26
这个keywords是怎么加的啊...在run files里面吗，卡开发发老师

DMol3 Calculation->files->save files，在产生的input里面改好，然后DMol3 Calculation->files->run files。大部分情况位移收敛差一点可以不用管。

zorow · 发表于 Post on 2018-5-7 09:39:47

卡开发发发表于 2018-5-6 21:26
DMol3 Calculation->files->save files，在产生的input里面改好，然后DMol3 Calculation->files->run fil ...

嗯嗯，明白了谢谢您的指点！

xiapin · 发表于 Post on 2021-6-23 12:49:37

本帖最后由 xiapin 于 2021-6-23 12:54 编辑

卡开发发发表于 2018-5-3 02:45
你可以在优化完的结构上继续优化看看是否还有这样的问题，如果不行的话可以试试直角坐标+GDIIS，这在接近极 ...

您好，卡开发发老师，我在用Dmol3做几何优化的时候也出现了前两个报YES，|dR|max报NO，优化好的基础上继续优化依然是两个YES，但都显示成功结束。该怎么处理呢? 如果想用您在此楼说的直角坐标+GDIIS，请问怎么在input文件里修改，直接加关键词opt=GDIIS吗？

卡开发发 · 发表于 Post on 2021-6-23 12:59:30

xiapin 发表于 2021-6-23 12:49
您好，卡开发发老师，我在用Dmol3做几何优化的时候也出现了前两个报YES，|dR|max报NO，优化好的基础上继 ...

优先考虑上面的Opt_Converge_All，你可以试着搜索一下help文档。使用方法上面几楼都有讨论，如果还有问题可以再继续讨论。

xiapin · 发表于 Post on 2021-6-23 13:35:35

本帖最后由 xiapin 于 2021-6-23 13:36 编辑

卡开发发发表于 2021-6-23 12:59
优先考虑上面的Opt_Converge_All，你可以试着搜索一下help文档。使用方法上面几楼都有讨论，如果还有问题 ...

我刚刚试了一下，加了Opt_Converge_All之后不能算，结果报错。您看加的位置对吗？我是在超算上投的任务。结构除了C、O、H外还含有6个Zr和1个Cu。

# Task parameters
Calculate                   optimize
Opt_energy_convergence       1.0000e-005
Opt_gradient_convergence    2.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003
Opt_iterations             500
Opt_max_displacement       0.3000 A
Opt_Converge_All
Symmetry                   off
Max_memory                   2048
File_usage                   smart
Scf_density_convergence    1.000000e-006
Scf_charge_mixing          2.000000e-001
Scf_spin_mixing             5.000000e-001
Scf_diis                   6 pulay
Scf_iterations             500

# Electronic parameters
Spin_polarization          unrestricted
Charge                      0
Basis                      dnp
Pseudopotential             dspp
Functional                   pbe
Aux_density                octupole
Dftd                         G06
DFTD_params                custom 0.7500 20.0000

Integration_grid             fine
Occupation                   thermal 0.0050
Cutoff_Global                5.3000 angstrom
Kpoints                      off

# Calculated properties

卡开发发 · 发表于 Post on 2021-6-23 13:40:23

xiapin 发表于 2021-6-23 13:35
我刚刚试了一下，加了Opt_Converge_All之后不能算，结果报错。您看加的位置对吗？我是在超算上投的任务。 ...

Opt_Converge_All on，这在help都有提到。

xiapin · 发表于 Post on 2021-6-23 13:44:17

卡开发发发表于 2021-6-23 13:40
Opt_Converge_All on，这在help都有提到。

哦哦，好的！我学着看help,谢谢您！

littleyang · 发表于 Post on 2022-8-26 09:18:14

xiapin 发表于 2021-6-23 13:44
哦哦，好的！我学着看help,谢谢您！

请问您成功了吗，我也遇到了同样的问题

克卜勒 · 发表于 Post on 2022-9-24 16:27:57

卡开发发发表于 2018-5-6 16:23
keywords: Opt_Converge_All了解一下

请问添加后有个计算的收敛条件表格只更新到step 8，后面就没了该怎么办呀

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