使用tip4p-ice时如何加入虚原子？

sj12138 · 发表于 Post on 2022-10-10 16:38:53

牧生发表于 2022-10-4 15:45
对于仅有水分子的体系，转为四点水模型以后，原子总数量就是对的。

如果含有其他的分子，那么转化后的 ...

嗯嗯十分感谢

youknowdcf · 发表于 Post on 6 hour ago

牧生发表于 2022-10-4 15:45
对于仅有水分子的体系，转为四点水模型以后，原子总数量就是对的。

如果含有其他的分子，那么转化后的 ...

你好，我想请问一下，用这种手动替换的方法和我在gromacs里用solvate -cs tip4p方法有什么区别吗，这样我可以直接得到加入盒子中的tip4p水分子，应该更简便吧？

牧生 · 发表于 Post on 5 hour ago

youknowdcf 发表于 2026-5-9 17:23
你好，我想请问一下，用这种手动替换的方法和我在gromacs里用solvate -cs tip4p方法有什么区别吗，这样我 ...

原则上是这样的。你可以怎么方便就怎么来

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