如何设置表面活性剂中各原子的电荷？

truemantwo · 发表于 Post on 2015-4-23 19:49:05

小弟想模拟表面活性剂（SDBS）。一般来说，SDBS的有机化合物部分（C、H、O），其总电荷数应该是-1；离子部分（Na）的电荷数应该是+1。

若用PCFF力场，发现它设置的电荷不正确：SDBS中有机化合物部分的总电荷是0，Na离子的电荷也设成了0。

如果是用COMPASS力场，发现体系的电荷设置基本合理：SDBS中有机化合物部分的总电荷是-1，Na离子的电荷设成了+1。

由于种种原因，我的计算不能采用COMPASS力场。

小弟想了一个办法：体系的电荷用COMPASS力场产生，但是其它部分用PCFF力场计算。不知是否合理？请各位指教。

感激不尽！

sobereva · 发表于 Post on 2015-4-27 14:31:10

你看看对于其它体系，PCFF计算时分配的原子电荷和COMPASS的有多大差异。如果大体相同，从COMPASS借过来电荷估计问题不大。

truemantwo · 发表于 Post on 2015-4-27 14:58:21

sobereva 发表于 2015-4-27 14:31
你看看对于其它体系，PCFF计算时分配的原子电荷和COMPASS的有多大差异。如果大体相同，从COMPASS借过来电荷 ...

谢谢sobereva大侠！

AbaFlu · 发表于 Post on 2019-3-27 23:19:19

验证了一下，似乎是可以的

tjyjy · 发表于 Post on 2023-1-26 20:59:03

你好，请问你在优化SDBS的时候，是如何选择charges的？（是参考一些论文的设置吗？）

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