namd建模时水盒示意图显示问题

xiaochenxi · 发表于 Post on 2018-5-15 13:27:28

你好：
我试了一下，我的是卟啉和水分子组成的pdb文件，在Graphics Representations中我只想让卟啉分子变成CPK形式，水分子不变，我在Selected Atoms中输入什么关键词才能实施这一步，因为我把selections中的singlewords词都试了不行，谢谢

somniferum · 发表于 Post on 2018-5-15 13:46:48

你用写字板pdb里面你的卟啉分子叫什么，例如UNK什么的，然后在selected atoms里面写resname "UNK"就选中你想要的了

978142355 · 发表于 Post on 2018-5-15 17:48:06

你可以建立两层，第一层中selected atoms中输入water，第二层中输入not water，然后第二层改成CPK模式就可以。

sobereva · 发表于 Post on 2018-5-15 20:01:31

绝对不要同一个问题在两处提问，注意看置顶的新人必读贴，在这帖子里我刚回完http://bbs.keinsci.com/thread-9976-1-1.html

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