计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 18 |主题 Threads: 13637|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 求助:能量极小化报错IMPORTANT: This should not happen ........ attachment Battleye 2023-10-14 11095 天田甜恬 2024-11-20 20:05
预览 [GROMACS] Gromacs蛋白质配体体系进行RMSF时图像异常问题 attach_img 一条空空的河 2024-11-16 2872 一条空空的河 2024-11-20 19:29
预览 [GROMACS] 使用gmx grompp进行nvt预平衡的时候出现报错 attach_img MediaX 2024-11-19 4821 MediaX 2024-11-20 19:03
预览 [GROMACS] 使用acpype将GAFF力场文件转化为gromacs文件后怎么include? attach_img  ...2 万年流星 2019-6-17 2324403 sobereva 2024-11-20 18:00
预览 [Amber] 用amber中的tleap处理蛋白质复合物,建立体系时报错 attach_img wwwv 2024-11-14 7777 wwwv 2024-11-20 16:49
预览 [GROMACS] 求助:求适用于OPLS-AA力场的Zn2+力场参数 zquan 2022-8-25 32978 xishaofan 2024-11-20 16:07
预览 [GROMACS] 求助:模拟产生临时tpr文件时报错:原子间最大距离大于截至距离。cutoff改后仍报错 attach_img jshxxxx 2024-11-20 2566 jshxxxx 2024-11-20 15:43
预览 [GROMACS] 求助PEG+水+核酸的混合溶液,溶剂该怎么去周期性边界条件 attach_img zhijiu 2024-11-20 2701 zhijiu 2024-11-20 15:27
预览 [VMD] 求助用vmd分析水中的氢键时每个水分子的氢键数与文献有差距 attach_img whyu 2024-11-19 61253 whyu 2024-11-20 14:32
预览 [Amber] Amber做SMD,小白求教 蓝沐轩_lemshine 2021-6-7 69969 数据挖掘 2024-11-20 13:53
预览 [Lammps] 请问LAMMPS软件使用 Buckingham Potential应该怎么设置atom_style vaspMeng 2023-5-18 42921 crychichi 2024-11-20 11:57
预览 [GROMACS] 做含磷小分子与其受体蛋白的模拟时去掉了1-4作用项,这种情况下还能分析静电作用么? attach_img JAM452 2024-11-17 6894 JAM452 2024-11-20 11:57
预览 [综合交流] 如何利用gromacs创建不同pH的膜环境 NEW12138 2024-11-19 1772 NEW12138 2024-11-20 11:18
预览 [GROMACS] 请问模拟脂多糖的分子力场应该如何选择 attach_img boyading 2024-11-20 0532 boyading 2024-11-20 09:59
预览 [GROMACS] 【已解决】分子进行位置限制后,同一个top文件,em正常,nvt报错 attach_img sdf 2024-11-19 21119 sdf 2024-11-20 09:53
预览 [GROMACS] gromacs分离CO2/N2, 遇到了CO2分子聚集的现象 attach_img lll123 2024-11-19 2852 sobereva 2024-11-20 05:41
预览 [GROMACS] 求助RNA+蛋白质+水的较大体系运算如何降低计算时间 高小白123 2024-11-18 4524 xsc6 2024-11-20 00:08
预览 [GROMACS] 非平衡MD的mdp设置求助 attach_img tjuptz 2021-8-10 1210261 云非侠 2024-11-19 20:47
预览 [GROMACS] 使用gromacs进行分子动力学模拟结束后观察结果遇到蛋白质和配体分开的问题 attach_img lmtt 2024-11-14 21226 lmtt 2024-11-19 19:30
预览 [NAMD] 求助粗粒度分子动力学模拟中CO2与不同珠子间的非键相互作用势能参数 郭晨晨 2024-11-19 0621 郭晨晨 2024-11-19 16:58
预览 [Material Studio] 求助在MS中进行水的MSD计算得到的log(MSD)和log(t)的线性关系斜率偏离1很大 qixueyuan 2024-11-19 0612 qixueyuan 2024-11-19 15:54
预览 [Amber] 如何评价amber24的新特性? attach_img z9527567 2024-5-2 71488 k64_cc 2024-11-19 11:39
预览 [其它程序] DPGEN训练集准备、训练参数的相关问题 attach_img Alset 2024-11-19 01662 Alset 2024-11-19 10:42
预览 [GROMACS] gromacs熔融退火过程应该在什么系综中进行? youknowdcf 2024-11-18 2686 youknowdcf 2024-11-19 08:48
预览 [分子对接] protein plus计算口袋体积问题-只能显示一个底物 attach_img s2023 2024-11-18 11097 sobereva 2024-11-19 08:46
预览 [GROMACS] 含非标准残基蛋白使用pdb2gmx转换结构后,螺旋结构消失,该如何解决? attach_img mtpeng 2024-11-18 2519 mtpeng 2024-11-19 08:31
预览 [GROMACS] 如何得到糖链的糖苷键二面角自由能景观图 attach_img Sunca 2024-11-18 0639 Sunca 2024-11-18 22:12
预览 [GROMACS] 如何用gromacs辅助确定超分子的结合方式 attach_img JCenter 2024-3-10 71558 tjuliuxue 2024-11-18 15:33
预览 [VMD] 如何在VMD中自动按设定顺序载入多个轨迹文件 attach_img NEW12138 2024-11-15 3762 NEW12138 2024-11-18 15:08
预览 [综合交流] 跑AIMD时平衡相阶段和产生相阶段的步长是否要一致 ljh123 2024-11-17 3971 sobereva 2024-11-18 13:29
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-5-13 19:40 , Processed in 0.236405 second(s), 19 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块