计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 0|主题 Threads: 13428|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] 在进行npt时,出现报错There is no domain decomposition for 24 ranks that is co... attach_img emmmmm 2024-9-27 1884 sobereva 2024-9-27 13:15
预览 [GROMACS] 请问GROMACS能不能做GCMC?? samuel 2024-9-27 1620 sobereva 2024-9-27 13:09
预览 [蒙特卡罗] 请问如何改变zif-8的孔径和孔隙结构? attachment pkl 2024-9-26 2714 sobereva 2024-9-26 22:14
预览 [GROMACS] 蛋白质-配体动力模拟平衡相MD的问题 xbzxx 2024-9-26 2870 sobereva 2024-9-26 22:13
预览 [GROMACS] 在LiFSI的溶液体系中计算RESP2电荷,隐式模型该如何选择? Yuki_ 2024-9-25 2631 Yuki_ 2024-9-26 21:38
预览 [GROMACS] 如何用mmpbsa方法计算蛋白不同构象的自由能而不是蛋白配体的结合能? 二次元phy宅鸮 2023-12-30 91677 Loading0760 2024-9-26 16:27
预览 [分子对接] 请问是否有只需要序列就可以批量对接的软件或者程序分享? Yothy 2024-9-26 1542 Loading0760 2024-9-26 16:03
预览 [VMD] 请问在VMD使用中,为什么用NewCatoon、Tube等显示有机物显示不出来?用CPK等就可以 attach_img xxx127 2024-9-24 4585 xxx127 2024-9-26 13:09
预览 [综合交流] 第一性原理分子动力学(拉伸、二面角旋转)如何在ORCA、CP2K等程序中实现 attach_img liuxdhs 2024-9-26 2821 liuxdhs 2024-9-26 10:22
预览 [粗粒化/DPD] 提问:请问粗粒化分子动力学与耗散粒子动力学有何区别? 万年流星 2019-5-23 915219 lixiao 2024-9-26 10:16
预览 [GROMACS] 经过周期性边界矫正,轨迹还是出现问题,一个蛋白出现在盒子的两边(已解决) attach_img Willow0114 2024-9-25 3601 M230351121 2024-9-26 09:35
预览 [GROMACS] 求助,gromacs模拟时什么时候要给初速度(gen_vel = yes) 非好汉 2023-4-13 92061 MilesYYh 2024-9-26 08:46
预览 [综合交流] 求助:短肽自组装纳米管如何建模 attach_img Senn 2024-9-25 11090 Senn 2024-9-25 19:44
预览 [GROMACS] 在进行NPT平衡时,报错:150 atoms are not part of any of the T-Coupling groups attachment Willow0114 2024-9-23 31121 Willow0114 2024-9-25 18:32
预览 [其它程序] gmx_MMPBSA计算时出现string index out of range报错如何解决 attach_img 12313 2024-9-25 0579 12313 2024-9-25 17:27
预览 [GROMACS] 求甲烷在水中扩散系数数据离谱 attach_img hzx 2024-9-25 3682 dzdhp 2024-9-25 16:33
预览 [Material Studio] 求助:MS NPT系综控压时希望xy尺寸不变,在Z方向变化该如何操作 attach_img ocbrother 2020-11-2 48487 13167129167 2024-9-25 16:18
预览 [GROMACS] 关于GROMACS模拟高温下蛋白变性情况的问题咨询 attach_img yolo-blossom 2024-9-23 2812 yolo-blossom 2024-9-25 14:12
预览 [综合交流] dpd耗散粒子动力学入门教材和软件有哪些 chuxuezhe 2024-2-27 113071 lixiao 2024-9-25 11:14
预览 [粗粒化/DPD] DPD模拟参数设置问题 attach_img LYL941 2022-1-21 116159 lixiao 2024-9-25 11:09
预览 [综合交流] Zn离子溶剂化结构配位数量问题 linyushuang 2024-9-24 1700 ultramanm87 2024-9-24 23:54
预览 [GROMACS] 蛋白被charmm-gui赋予电荷值是怎么得到的? 乐乐乐 2024-9-24 10930 student0618 2024-9-24 21:50
预览 [Lammps] lammps例子个人搜集-2015年 attachment heatlevel agree  ...23 朱雪刚 2015-8-14 3988556 shc 2024-9-24 20:42
预览 [Lammps] GRIDVIEW平台运行LAMMPS中的ReaxFF报错ERROR:Unknown command tanglj22 2024-9-24 0832 tanglj22 2024-9-24 20:31
预览 [VMD] 利用VMD计算孔道内水合离子的RDF的设置问题 attach_img lucky1999 2023-8-28 41940 lucky1999 2024-9-24 19:33
预览 [GROMACS] 关于gromacs初速度设置的问题 王采岑 2021-4-13 314538 MilesYYh 2024-9-24 18:09
预览 [Lammps] 如何更快地创建出lammps运行所需要的含有原子电荷的data文件? wjwh 2023-2-6 62105 1028181661 2024-9-24 18:07
预览 [其它程序] 如何使用gmx_MMPBSA计算没有配体的单个蛋白的结合自由能? 12313 2024-9-23 3677 12313 2024-9-24 16:56
预览 [GROMACS] 求助:如何通过gmx current命令正确计算溶液的静态电导率 attachment 小菜狗 2023-8-30 21942 neoje 2024-9-24 15:58
预览 [GROMACS] 求助:判断动力学模拟后蛋白结构是否稳定的主要依据是RMSD吗? attach_img 阳台的茵蒂克丝 2021-5-23 1016972 MilesYYh 2024-9-24 15:32
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-28 00:32 , Processed in 0.236219 second(s), 18 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块