“第25届北京科音初级量子化学培训班” 将于6月11至14日于北京举办,是初学者真正从头一次性完整、系统性学习量子化学计算,从而能很快上手量子化学研究的重要机会,比起自己摸索、鼓捣能少走无数弯路。报名正在进行中,请点击此链接查看,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (193) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 5 |主题 Threads: 13682|排名 Rank: 4 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [VMD] 模拟中钙离子会和磷酸根离子结合,如何编写TCL脚本,计算蛋白质一定范围内结合物数量 attach_img Willow0114 2024-8-29 1913 sobereva 2024-8-30 08:09
预览 [综合交流] 利用zeo++计算MOF的孔径时候遇到了一些问题 啦啦啦` 2024-8-29 11246 sobereva 2024-8-30 07:52
预览 [GROMACS] GROMACS做水乙醇互溶现象模拟时出现Atomtype c3 not found该怎么解决 attach_img ejath 2024-8-28 31138 sobereva 2024-8-30 07:31
预览 [综合交流] 做一些纳米材料的计算,机器学习软件咨询 薛定谔的老猫 2024-8-29 61186 薛定谔的老猫 2024-8-30 00:00
预览 [Material Studio] MS种用forcite跑分子动力学模拟因部分结构固定运行失败 attachment zzk 2021-11-25 65972 xylz6188 2024-8-29 23:23
预览 [综合交流] 钙离子与蛋白质之间的盐桥数量和距离蛋白质一定范围内钙数量有什么关系吗? Willow0114 2024-8-29 0949 Willow0114 2024-8-29 22:40
预览 [VMD] TCL编写计算蛋白质6A范围内的钙离子,可以运行,但是结果不对 attach_img Willow0114 2024-8-29 2766 Willow0114 2024-8-29 22:12
预览 [Lammps] 求助:LAMMPS进行NPT模拟,盒子尺寸变化不明显,分子出现聚集情况 attach_img 明明有月 2024-8-29 0966 明明有月 2024-8-29 19:53
预览 [VMD] VMD计算径向分布函数时出现错误measure gofr: only orthorhombic cells are supported attach_img hanmengsha 2023-10-25 113005 小航 2024-8-29 16:30
预览 [Material Studio] MS聚合物模拟focite模块几何优化能量降不下来 咖啡豆 2022-7-14 72658 quantangmeishi 2024-8-29 16:01
预览 [Lammps] 求助:键长键角二面角分布统计 attach_img luogaoyang123 2023-4-2 94704 759884279 2024-8-29 14:25
预览 [GROMACS] 用vmd显示sdf计算结果里面中心分子的每一个原子周围也有溶剂分布 attach_img pg-zhd 2024-8-26 4985 pg-zhd 2024-8-29 14:22
预览 [Material Studio] Forcite几何优化报错问题 diyuli 2020-7-14 210544 quantangmeishi 2024-8-29 09:17
预览 [GROMACS] 使用MMPBSA计算结合自由能,强弱结合的依据文献来源? AKB2005 2024-8-28 1947 c00jsw00 2024-8-29 00:32
预览 [Material Studio] 关于模拟动力学过后键特别长的问题 attach_img zxc 2022-11-6 22627 人生若只如初见 2024-8-28 20:05
预览 [GROMACS] 求助有关gmx dipoles命令产生的各种文件具体含义和细节 attach_img agree duzy 2024-4-13 61804 1154975925 2024-8-28 20:04
预览 [GROMACS] 进行位置限定时,原子序号发生变化 attach_img Willow0114 2024-8-28 2936 Willow0114 2024-8-28 19:47
预览 [GROMACS] 聚合物缠绕碳纳米管体系的模型怎么搭建? attach_img 李小泽 2024-8-27 41109 李小泽 2024-8-28 19:09
预览 [GROMACS] gromacs 计算出的分子间相互作用能数据不对是什么原因 attach_img Sunca 2024-8-27 22571 Sunca 2024-8-28 17:59
预览 [综合交流] 求助:偏置势是什么,该如何理解? HuangYiF 2022-8-8 23447 八力八力卜 2024-8-28 17:29
预览 [GROMACS] 求助:如何用gmx gangle计算一个向量和Z轴的二面角 Jus 2023-1-28 82224 yilan 2024-8-28 16:56
预览 [GROMACS] 分子动力学结果阴阳离子聚集 attach_img 执笔勾勒神话 2024-8-28 11016 sobereva 2024-8-28 16:10
预览 [GROMACS] 按照文献在gromacs自带的amber力场里面,添加离子参数与自带离子参数的对比问题  ...2 牧生 2022-5-28 2915548 shadowcrystal 2024-8-28 15:08
预览 [综合交流] 请问文献中的分子模拟构象图是用什么软件做出来的? attach_img pu1p 2024-8-27 61076 pu1p 2024-8-28 14:38
预览 [Amber] MMPBSA 出现错误PB Bomb in pb_aaradi(): No radius assigned for atom的解决办法 attach_img agree ggdh 2017-8-23 414265 哈哈 2024-8-28 14:32
预览 [GROMACS] MMPBSA可以计算蛋白质和某一个离子之间的能量吗? Willow0114 2024-8-27 2746 Willow0114 2024-8-28 13:40
预览 [GROMACS] (已解决)PDB下载的蛋白质文件缺失部分氨基酸残基,影响RMSF结果分析(以残基为x) attach_img chenwei 2024-8-26 65283 chenwei 2024-8-28 11:16
预览 [GROMACS] 这个二面角应该怎么拟合? attach_img 社会主义小战士 2024-8-27 1911 sobereva 2024-8-28 09:16
预览 [GROMACS] gromacs跑完nvt之后分子结构发生变化? attach_img 1367 2024-8-27 11004 sobereva 2024-8-28 09:13
预览 [GROMACS] 求助:在拖拽小分子时出现部分原子不在 T-Coupling groups attachment emmmmm 2024-8-26 41812 Seyilaxa 2024-8-27 23:57
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-6-1 19:39 , Processed in 1.637899 second(s), 18 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块