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分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 9 |主题 Threads: 13679|排名 Rank: 4

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预览 [GROMACS] 求助在做gromacs md模拟时出现警告atoms are not part of any of the VCM groups	Wxy1998 2023-4-11	22447	Wxy1998 2023-4-11 21:25
预览 [Lammps] 文献中新提出来的力场参数怎么能够在lammps中使用呢？	wjwh 2023-3-2	11783	tracer 2023-4-11 20:41
预览 [Amber] 求助：请问frcmod文件中出现ATTN，need revision 时应该怎么手动修改？	0A0 2023-4-11	01263	0A0 2023-4-11 14:49
预览 [Lammps] 求助：data文件转换成gro top文件问题	haijiayuan 2023-4-11	01008	haijiayuan 2023-4-11 13:44
预览 [GROMACS] 求助纳米金颗粒加入冰水混合物进行能量最小化后跑散的问题	ysrhhhh 2023-4-11	12322	sobereva 2023-4-11 12:14
预览 [Lammps] lammps输出密度后如何使用origin作云图？	mengxiangidea 2023-4-10	01918	mengxiangidea 2023-4-10 22:37
预览 [GROMACS] NVT和NPT的平衡相模拟必须都进行吗？	lufenghxu 2023-4-10	22946	sobereva 2023-4-10 17:28
预览 [GROMACS] 请教不同力场加氢规则不一样，产生的gro文件为什么差异很大？	lufenghxu 2023-4-9	31446	lufenghxu 2023-4-9 23:20
预览 [GROMACS] 求教：使用sobtop生成MOF的两个itp文件，一个做能量最小化失败，另一个正常	a9471163 2023-4-3	43385	a9471163 2023-4-9 11:37
预览 [GROMACS] 求助，用gromacs做蛋白和偶氮分子的动力学模拟，如何保持氮氮双键构型不变？	ikun 2023-4-5	61436	喵星大佬 2023-4-8 14:50
预览 [Sobtop] 学习sobtop例5，调用openbabel时出现如下错误	Mingyu 2022-9-1	103181	murphy 2023-4-7 01:10
预览 [综合交流] 新手求教，主要做电催化方向，选择lammps和gmx哪个好	gejuqing 2023-2-25	31616	sobereva 2023-4-6 06:35
预览 [Amber] 如何将amber的top文件转化为gromacs的top文件	kjxwl3 2017-9-18	1317211	sobereva 2023-4-6 06:25
预览 [GROMACS] 求助：关于gromacs续跑的问题	wyxlfw 2023-4-4	23005	wyxlfw 2023-4-5 11:13
预览 [GROMACS] 请问如何计算环糊精金属有机框架（CD-MOF-1）体系的原子电荷	clh 2023-4-4	31659	bobosiji 2023-4-5 09:59
预览 [GROMACS] 模拟碳纳米管时报错	wad 2023-4-4	11336	sobereva 2023-4-5 07:29
预览 [GROMACS] 求助使用gmx gyrate的时候，受到了周期性的干扰，如何解决？	小梁加油鸭 2023-4-4	11203	sobereva 2023-4-5 07:27
预览 [GROMACS] 求助在核酸模拟中用gmx pdb2gmx命令时无法产生拓扑结构，提示该原子在rtp中没有力场	duzy 2023-4-5	1987	sobereva 2023-4-5 07:18
预览 [GROMACS] 求助，计算分子间的相互作用能前的轨迹提取问题	tym1999 2023-4-4	11399	sobereva 2023-4-5 07:13
预览 [GROMACS] 请教MMPBSA能量分解时，谷氨酸的PB值非常大（正值），怎么解决	shifan 2023-4-4	0840	shifan 2023-4-4 20:56
预览 [Lammps] 求助，一使用fix deposit命令就报错	tangtang22 2022-3-26	14119	strawberrykille 2023-4-4 20:47
预览 [GROMACS] 我生成的纤维素top文件中，一些原子的电荷为0，我想知道这是否会对模拟造成影响？	huashang 2023-3-30	21245	huashang 2023-4-4 20:30
预览 [其它程序] 求助：PyMOL残基Label三字母缩写修改问题	charmm36 2023-4-3	22478	charmm36 2023-4-4 19:50
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