计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (193) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 12 |主题 Threads: 13679|排名 Rank: 4 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [Amber] Error: Bad topology file. attachment 15whyhq 2017-3-16 29635 musaxisuoke 2023-1-12 00:40
预览 [GROMACS] 求助 LigParGen产生力场参数文件失败 attach_img 晓滨MD 2021-11-24 53678 chenzikang715 2023-1-11 17:53
预览 [GROMACS] 求助nvt下气液界面体系的密度命令 qiyan 2022-3-31 33757 yee 2023-1-11 17:50
预览 [Lammps] lammps单位换算问题 attach_img ProDreamer 2023-1-11 01673 ProDreamer 2023-1-11 11:26
预览 [GROMACS] 关于gromacs中sasa计算问题 xuxu 2023-1-10 22490 xuxu 2023-1-11 11:24
预览 [综合交流] 使用VMD中的topo模块构建 .data, .psf, .top文件 attach_img heatlevel agree  ...2 ruanyang 2016-12-21 2258958 neocc 2023-1-10 17:22
预览 [GROMACS] 请问在gromacs的模拟过程中能否限定盒子内的分子在整个模拟过程中不出盒子? UTM 2023-1-8 92534 UTM 2023-1-10 16:09
预览 [VMD] 请问如何让多肽N端到C端颜色过渡? attach_img bingzan 2023-1-6 71819 bingzan 2023-1-10 11:52
预览 [综合交流] 求助:Lammps并行不运行 Sureviver 2023-1-10 01662 Sureviver 2023-1-10 10:07
预览 [GROMACS] 请教在运行MMPBSA时遇到如下问题如何解决 attach_img yaoyuan 2023-1-10 01387 yaoyuan 2023-1-10 09:00
预览 [Material Studio] 求助:forcite 模拟有机物在金属表面吸附时总是出错 小刚仔 2023-1-9 95505 小刚仔 2023-1-9 23:59
预览 [GROMACS] ATB保存文件时的问题 attach_img wangdafeixh 2022-1-23 103635 sobereva 2023-1-9 23:25
预览 [GROMACS] Gromacs求助,如何用命令测量MD下复合物氢键长度 attach_img danyunlee 2023-1-8 11672 sobereva 2023-1-8 23:45
预览 [GROMACS] 求助,请教opc水itp文件里的settle怎么修改 attachment ogrebit 2023-1-6 52052 ogrebit 2023-1-8 20:01
预览 [VMD] 请教各位,如何去掉模拟体系轨迹文件中的水分子 attach_img huhq 2023-1-6 54806 huhq 2023-1-8 18:15
预览 [综合交流] 计算分子动力学轨迹中两个环平面间的距离和夹角 attach_img digest agree sobereva 2021-3-3 1323463 sobereva 2023-1-8 05:44
预览 [Amber] 求助:预平衡好的溶剂盒子密度是正确的,但是将底物导入溶剂盒子再平衡后,密度改变 attachment 哇卡卡卡卡卡 2023-1-3 41594 UTM 2023-1-7 16:09
预览 [Material Studio] gateway连接服务器,只有一个线程 attach_img faylovesnow 2023-1-1 41596 faylovesnow 2023-1-7 15:56
预览 [GROMACS] 根据Gromacs官网命令计算氢键,报错。 attach_img danyunlee 2023-1-6 21573 sobereva 2023-1-7 08:15
预览 [蒙特卡罗] 求助:逸度系数的计算 霍亚金 2021-6-17 49927 chands 2023-1-6 23:47
预览 [Material Studio] 求助在MS中使用粗粒化模块中NVT模拟后,原子轨迹都跑出盒子了 attach_img sunyingtao 2023-1-4 22920 sunyingtao 2023-1-6 14:20
预览 [Lammps] 求助:关于固定原子组,去除固定后,用不用给该组一个速度? 畅想到了没 2023-1-6 01403 畅想到了没 2023-1-6 10:28
预览 [GROMACS] 纯二氯甲烷npt平衡时,盒子一直增大 attach_img Alan123 2023-1-4 22804 Alan123 2023-1-5 10:38
预览 [GROMACS] 求助柔性多肽分子动力学模拟的收敛问题 attach_img dzhen1 2023-1-4 51838 dzhen1 2023-1-5 10:04
预览 [VMD] 请教各位VMD1.9.3版载入psf和dcd文件后闪退原因 attach_img huhq 2023-1-4 43023 huhq 2023-1-5 08:53
预览 [VMD] 求助VMD载入轨迹文件报错 attach_img dzhen1 2023-1-4 21897 dzhen1 2023-1-4 23:33
预览 [GROMACS] gromacs力场参数拟合 attach_img 哆啦哆啦 2018-4-13 818479 linzhizh 2023-1-4 20:59
预览 [VMD] VMD如何解决分子团簇穿越边界的问题 attach_img moritaichi 2023-1-3 46320 naoki 2023-1-4 15:51
预览 [Amber] 求助:蛋白质配体复合物在不同温度下的MD 阿志 2023-1-3 41925 阿志 2023-1-4 13:35
预览 [Material Studio] 将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法 (支持导出晶格信息) attachment agree goldNAN 2023-1-4 13784 suihg 2023-1-4 10:25
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-5-30 20:00 , Processed in 0.666831 second(s), 19 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块