计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 21 |主题 Threads: 13421|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] gromacs模拟关于comm-grps和mode的选择和设置问题 uenh1998 2022-3-30 107844 sobereva 2022-8-30 11:04
预览 [VMD] 求助:VMD能通过tcl脚本导入多个pdb文件合成一个frame吗? calcifa 2022-8-27 33023 sobereva 2022-8-30 10:44
预览 [Sobtop] Sobtop结合ParmEd产生Amber拓扑文件报错 attachment Kalinite 2022-8-29 01896 Kalinite 2022-8-29 21:08
预览 [GROMACS] MD模拟溶液在石墨烯界面的吸附,在z方向加真空层,离子会越过真空层,请问如何解决 attach_img wyx123 2022-8-26 22598 wyx123 2022-8-29 17:00
预览 [Amber] 求助 :Amber产生小分子gaff力场 如何产生三维尺寸不一样的溶剂化盒子 attach_img cmd27 2022-8-28 22215 cmd27 2022-8-28 16:16
预览 [GROMACS] 请问mdrun未达预想中的速度的排查解决方案 zjq0717 2022-8-27 12296 sobereva 2022-8-28 10:10
预览 [GROMACS] 可以用GROMACS模拟两个有机物在一起的挥发过程吗?  ...2 蕊蕊花儿杰杰 2021-4-8 1519718 seaflyru 2022-8-27 21:00
预览 [Amber] 能量最小化并未生成新的坐标文件 attach_img SuXXXX 2022-8-26 21683 SuXXXX 2022-8-27 16:06
预览 [VMD] 求助VMD如何动态绘制分子的偶极矩? attach_img lishine 2022-8-26 23032 lishine 2022-8-27 15:08
预览 [GROMACS] GROMACS将小分子牵引过细胞膜出现牵引方向相反的问题 attach_img 熊小熊 2022-8-26 22399 熊小熊 2022-8-26 20:12
预览 [综合交流] 利用Q-force导出分子力场参数遇到的python报错问题 attach_img Windln 2022-8-26 01695 Windln 2022-8-26 19:41
预览 [GROMACS] 为什么LigParGen无法构建阴离子拓扑文件? attach_img Aristotler 2020-10-28 49136 牧生 2022-8-26 19:03
预览 [Amber] ASMD中py2脚本在py3中不适用,求助 attach_img 知黑守白 2021-5-12 39038 amber菜鸟 2022-8-26 16:41
预览 [Amber] 用amber进行TI模拟后如何进行数据处理? attachment hubiyun 2022-8-26 11818 hubiyun 2022-8-26 15:48
预览 [GROMACS] 求助:能量最小化后分子构型发生很大变化 attachment 芮啦 2022-8-25 32351 芮啦 2022-8-26 14:48
预览 [综合交流] Amber格式力场转换成Gromacs格式的方法请教 attach_img uenh1998 2022-1-11 55563 大头攒毛 2022-8-26 14:43
预览 [GROMACS] 求助:怎么在top和gro文件中手动修改把氨基酸的s元素替代为硒元素? root9527 2022-8-25 11900 sobereva 2022-8-26 14:03
预览 [GROMACS] 求助分析gromacs模拟短肽和一个膜蛋白的相互作用的动力学的结果 352622668 2022-8-26 21806 sobereva 2022-8-26 13:59
预览 [综合交流] packmol软件中我定义的原子数量是否合理? mengxiangidea 2022-8-24 142609 mengxiangidea 2022-8-26 13:56
预览 [综合交流] 求助,mol2文件格式问题 attach_img 那年冬天风在吹 2022-8-26 02047 那年冬天风在吹 2022-8-26 10:30
预览 [GROMACS] 蛋白质如何质子化 attach_img lishine 2022-8-24 75847 lishine 2022-8-26 09:46
预览 [GROMACS] Gromac跑膜的溶胀,运行NVT正常,但运行NPT初始就报错 小心怪 2022-4-22 53935 xiaoruoqiu 2022-8-25 22:18
预览 [GROMACS] 求助 Gromacs 伞形采样脚本运行错误 hhhnano 2021-2-3 18572 szh 2022-8-25 14:19
预览 [蒙特卡罗] 蒙特卡洛模拟DNA断裂的问题 smile2022 2022-8-25 02198 smile2022 2022-8-25 10:30
预览 [GROMACS] 求助:安装gromacs后跑pdb2gmx中PCA1--LEU496报错 attach_img BabysBreath 2022-8-16 52308 sobereva 2022-8-25 09:13
预览 [Material Studio] 求助:使用material studio软件基于MD计算分子在不容温度下的分解特性 hiramqdl 2022-8-24 12134 sobereva 2022-8-25 08:58
预览 [GROMACS] 求助:如何用[position_restraints]限制DPPC脂双层上半层的氮原子? xiaoruoqiu 2022-8-24 22004 xiaoruoqiu 2022-8-24 21:49
预览 [Amber] Amber的mmpbsa用PBSA计算极性溶剂化自由能的方法更新过吗 Dongxiao 2022-8-24 21799 Dongxiao 2022-8-24 17:39
预览 [Amber] amber在最后生成拓扑文件和坐标文件遇到报错 attach_img SuXXXX 2022-8-24 42625 SuXXXX 2022-8-24 14:23
预览 [GROMACS] 使用gmx_MMPBSA时,用gromacs2020如何获取nopbc的复合物轨迹 smk 2022-8-24 02390 smk 2022-8-24 13:26
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 23:40 , Processed in 0.205703 second(s), 18 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块