计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 0|主题 Threads: 13596|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [VMD] 请教大家,画MD的示意图有什么软件? Wangzq 2022-1-7 23284 Wangzq 2022-1-8 10:59
预览 [Lammps] 求助LAMMPS如何统计水分子从哪个区域蒸发的 Wangzq 2022-1-7 23638 Wangzq 2022-1-8 10:58
预览 [GROMACS] gmx mmpbsa使用前,是否需要手动预处理模拟轨迹 attach_img a9471163 2022-1-7 23499 a9471163 2022-1-8 10:04
预览 [GROMACS] 请教计算蛋白质的回旋半径产生的TM.xvg文件的内容 attach_img 灵芝5 2022-1-7 23885 灵芝5 2022-1-8 08:58
预览 [综合交流] 如何理论计算一个小分子的IC50值 weixue 2022-1-7 24195 sobereva 2022-1-7 22:25
预览 [综合交流] 请问怎么使用ACD/ChemSketch计算logP weixue 2022-1-7 87975 sobereva 2022-1-7 22:15
预览 [GROMACS] gromacs里怎么控制PH? huidaoguoquo 2015-12-17 720178 sobereva 2022-1-7 22:07
预览 [综合交流] 已解决:什么方法可以做到把特定组氨酸突变为质子化状态? attach_img Kamala 2022-1-6 84067 sobereva 2022-1-7 22:06
预览 [蒙特卡罗] 用raspa计算GCMC总是停止,不出现output文件 attach_img liuzl 2022-1-7 03905 liuzl 2022-1-7 16:34
预览 [GROMACS] 求助:为什么acpype.py生成小分子的top文件时,linux系统会报错? attach_img FLO 2022-1-6 64141 心向暖阳 2022-1-7 15:17
预览 [GROMACS] gromacs怎么进行溶液的拉伸动力学模拟? attach_img atomhong 2021-4-15 714154 努力学习 2022-1-7 15:06
预览 [GROMACS] pdb2gmx生成的gro文件中蛋白质键发生断裂 attach_img 何庆 2022-1-6 12665 panernie 2022-1-7 11:51
预览 [GROMACS] 求助:Merz参数的选择问题 邱美佳 2022-1-7 23138 sobereva 2022-1-7 10:51
预览 [GROMACS] 基于常规MD模拟后的结果改用不同的.mdp再跑一段时间相关问题 attach_img uenh1998 2022-1-6 23282 uenh1998 2022-1-7 09:02
预览 [蛋白质建模] 求助:同源模建模板蛋白和目标蛋白的序列一致性需要大于 30%出于那篇文献 沐雨书生 2022-1-6 24057 c00jsw00 2022-1-7 08:03
预览 [GROMACS] 求助氢气穿透聚乙烯体系能量最小化时报错 attach_img 风起于夏 2022-1-5 43299 风起于夏 2022-1-6 12:59
预览 [综合交流] 关于Metadynamics填充高斯波包的疑问 attach_img agree 函数与激情 2022-1-6 43967 函数与激情 2022-1-6 12:07
预览 [GROMACS] 请教关于如何统计每一个残基和全部水的氢键数量 attach_img Aristotler 2022-1-6 24908 Aristotler 2022-1-6 11:14
预览 [GROMACS] 求助:请问模拟水的相变用什么水模型好 attach_img 邱美佳 2022-1-6 13715 sobereva 2022-1-6 05:26
预览 [VMD] vmd里如何输出所有resid质心随时间的变化? attachment tangzi_via 2021-11-15 64948 tangzi_via 2022-1-5 14:55
预览 [GROMACS] 使用ATB现有的分子生成的拓扑文件到gromacs中计算得到的密度与实际不符的问题 attachment yee 2022-1-4 26693 yee 2022-1-5 09:41
预览 [GROMACS] 运行NVT时,生成很多step文件,不知道是什么原因 attach_img CMMCMM 2022-1-4 23451 CMMCMM 2022-1-5 09:30
预览 [综合交流] 提问:关于NVT和NPT模拟中恒温器和恒压器的选择 dlldwtz 2022-1-4 36669 sobereva 2022-1-5 09:05
预览 [GROMACS] 求助:用gromacs计算体系在不同温度下的热力学性质,有什么更加方便的途径吗 邱美佳 2022-1-4 23270 sobereva 2022-1-5 02:29
预览 [综合交流] 深度学习预测化合物性质预测方面的内容,投稿期刊求推荐 jack-cadd 2022-1-4 34525 sobereva 2022-1-5 02:19
预览 [VMD] 如何在Linux命令行/Python中调用vmd并运行tcl命令? Xcution 2022-1-4 25380 Xcution 2022-1-4 17:05
预览 [其它程序] 把蛋白和辅酶的复合物作为受体,如何用gmx_mmpbsa计算底物小分子的结合自由能? ecolitib 2021-12-29 13430 ecolitib 2022-1-4 16:35
预览 [综合交流] 关于拉氏图的问题 xuxu 2022-1-3 23640 xuxu 2022-1-4 12:37
预览 [Amber] 求助氨基酸突变相关问题 Kamala 2022-1-4 03509 Kamala 2022-1-4 11:31
预览 [Lammps] 分子动力学中水分子在三个方向的受力,就等于其中三个原子在在各方向的受力和吗? attach_img ymsw_zzw 2022-1-3 63406 喵星大佬 2022-1-4 10:45
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-25 07:24 , Processed in 0.270956 second(s), 19 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块