计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 22 |主题 Threads: 13465|排名 Rank: 3 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
预览 [GROMACS] mmpbsa计算出现报错:Structure contains ligand molecules, but no template defined attach_img 小马仙人 2025-9-8 0213 小马仙人 2025-9-8 18:04
预览 [GROMACS] 求助:两相萃取过程,单独的油相和水相的静电荷不为0 随我旅行可好 2025-9-8 1247 sobereva 2025-9-8 13:41
[NAMD] 多肽穿越纳米孔前后电流没有发生改变 - [阅读权限 200]attach_img 人生若只如初见 2025-8-11 2228 Uus/pMeC6H4-/キ 2025-9-8 10:02
预览 [GROMACS] 伞状抽样利用pull无法让配体沿着能垒最小路径脱离蛋白,如何解决? AxiEJohn 2025-9-7 2272 AxiEJohn 2025-9-7 15:37
预览 [Sobtop] 为什么我在用sobtopo生成的H2PO4-多了两个键? attach_img ztt20020107 2025-9-5 6439 ztt20020107 2025-9-6 18:47
预览 [GROMACS] 二面角势能项拟合的问题 attach_img  ...2 yaochuang 2019-9-12 2415602 snljty2 2025-9-6 16:36
预览 [GROMACS] gromacs模拟蛋白质吸附在金平面,RMSD后期波动,我想问结构稳定了吗? attach_img 十四~ 2025-9-5 5372 sobereva 2025-9-6 16:30
预览 [GROMACS] 电荷未中和的溶液体系,溶剂分子到处跑的深层次原因咨询 attach_img 牧生 2025-9-6 1303 sobereva 2025-9-6 16:17
预览 [虚拟筛选] 如何将excel表格中小分子smile批量转换成三维sdf格式的分子? attachment 志同道合 2025-9-6 2726 student0618 2025-9-6 14:50
预览 [虚拟筛选] 如何批量将小分子PDB转化为PDBQT并进行MMFF94能量最小化 志同道合 2025-9-4 5695 student0618 2025-9-6 14:48
预览 [GROMACS] 求助:gromacs伞形采样计算PMF可否对不同点设置不同的力? SpongeBob 2020-11-12 18430 雷阵雨 2025-9-6 14:46
预览 [GROMACS] 求助:windows编译GPU版gromacs是否有运算上限?如何减少时间? attachment xiaojue251 2025-9-4 14531 lmch 2025-9-5 23:45
预览 [GROMACS] 求助对单链蛋白使用pdb2gmx命令产生的拓扑文件,加入配体gro文件后配体与蛋白质脱离 attach_img Drucula 2025-9-4 2240 Drucula 2025-9-5 20:35
预览 [综合交流] 这种透明的水分子,可以用OVITO渲染lammps输出的xyz文件得到吗? attach_img sigusigu 2025-3-9 91160 perfectasdzz 2025-9-5 16:13
预览 [GROMACS] 求助:有机小分子拓扑文件制作工具 crush 2025-9-4 8346 KazusaT 2025-9-5 15:36
预览 [GROMACS] gromacs计算聚合物与碳纳米管之后,如何分析得到接触面积和结合能? attach_img xzeli 2025-9-5 2344 xzeli 2025-9-5 14:12
预览 [GROMACS] 求助:已达平衡的体系跑产生相时又不平衡 attach_img oillio 2025-9-4 4316 sobereva 2025-9-5 11:45
预览 [综合交流] 求助:关于分子运动轨迹图的疑问 attach_img Lisy 2025-9-4 2314 KazusaT 2025-9-4 22:24
预览 [GROMACS] gromocas定义二茂铁在N端修饰的非天然残基报错 attach_img xsc6 2025-9-4 0256 xsc6 2025-9-4 19:54
预览 [分子对接] 询问分子对接模拟课程 ywj374124193 2025-9-3 3595 sobereva 2025-9-4 19:11
预览 [GROMACS] 求助:怎么计算每个水的氢键数目 attach_img 巴普洛夫的狗 2025-9-3 4329 sobereva 2025-9-4 19:11
预览 [GROMACS] 求助研究一种乳酸和一种季铵盐在不同盐浓度下的吸附情况的力场选择 风神Mukhta 2025-9-4 3433 sobereva 2025-9-4 18:46
预览 [GROMACS] 含有铜离子的蛋白质和含有Zn离子的蛋白质进行蛋白配体的动力学模拟时的力场问题 attach_img 志同道合 2025-8-31 10538 tptp 2025-9-4 13:09
预览 [GROMACS] gromacs平衡时遇到cut-off过长怎么办 attach_img 笨笨鸟 2025-8-30 1325 笨笨鸟 2025-9-4 11:42
预览 [综合交流] 求助:如何将三斜晶体转化成正交晶体结构? attachment Lisy 2025-9-4 2440 Lisy 2025-9-4 11:13
预览 [GROMACS] gromacs如何选择平衡路径参数(有机共轭分子体系) lts! 2025-9-3 3400 lts! 2025-9-4 10:02
预览 [Material Studio] 求助,想请问一下MS能够计算油的动态介电常数吗? zhongyifan 2025-9-4 0238 zhongyifan 2025-9-4 09:52
预览 [Lammps] 在模拟Al与苯丙三氮矬时,运行lammps时原子不见的问题 attachment Yuki123456 2025-9-3 1269 sobereva 2025-9-4 07:55
预览 [Lammps] 在linux mint21.3上安装含kokkos以及deepmd的lammps & 4090的reaxff测试 attach_img digest agree 小葱拌豆腐 2024-6-24 103460 ggshining 2025-9-3 23:07
预览 [Lammps] 模拟电镀过程中预平衡出错 attach_img YwzY 2025-9-3 0240 YwzY 2025-9-3 17:17
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-3-11 23:06 , Processed in 3.267497 second(s), 17 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块