计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
收藏本版 Add to favourite (192) |订阅

分子模拟 (Molecular Modeling) 今日 Today: 9 |主题 Threads: 13637|排名 Rank: 2 

版主 Moderator: sobereva
作者
Author
回复/查看
Reply/View
最后发表
Last post
[GROMACS] 求助能量最小化后体系能量还是很高 - [阅读权限 255]attach_img huangzi 2025-8-2 7223 huangzi 2025-8-3 10:43
预览 [综合交流] 求助金属离子蛋白-小分子配体结合能计算问题,考虑配位残基计算为正 attach_img SUOLQWEE 2025-7-30 1538 student0618 2025-8-3 00:36
预览 [GROMACS] 如何合理选取扩散系数的拟合区间 attach_img Tracy民工 2025-8-1 5580 sobereva 2025-8-2 21:11
预览 [VMD] VMD模拟 writepdb命令无法生成并修改新的pdb文件 伶俜徒奈何 2024-3-29 51353 想科研的小C 2025-8-2 17:52
预览 [Sobtop] 教程例5 获得MMFF94电荷报错(sobtop_1.0(dev3.1)) yygong 2022-7-29 43686 PLwang 2025-8-2 14:58
预览 [GROMACS] gro和g96文件模拟Einstein晶体可能存在bug attach_img Lacrimosa 2025-8-2 0444 Lacrimosa 2025-8-2 10:22
预览 [GROMACS] 聚合物在npt之后模拟盒子中分布不均匀,有很多空隙 attachment huangzi 2025-8-1 2511 huangzi 2025-8-2 00:24
预览 [综合交流] 求助热力学积分法计算熵变 attach_img Tifo 2025-2-14 2840 dmh1998dmh 2025-8-1 21:37
预览 [GROMACS] 自创用于自动化绘制RDF与配位数曲线的程序 attach_img agree lucky1999 2024-8-1 72021 Linger 2025-8-1 16:10
预览 [VMD] 求助:请问为什么算出来的锌氧RDF不符合预期? attach_img 林俊杰 2025-7-29 6576 林俊杰 2025-8-1 15:56
预览 [综合交流] 求助,铁纳米颗粒(团簇体)的Amber力场非键参数 attach_img gaochangcheng 2025-6-22 141063 牧生 2025-8-1 13:54
预览 [GROMACS] 配体模拟过程中构象不符合预期有没有必要使用元动力学? attach_img reniiiiuuu 2025-7-30 5532 sobereva 2025-8-1 12:52
预览 [GROMACS] 关于GROMACS多肽与受体间氢键数据绘图问题 attach_img 樊樊樊 2025-7-31 4555 樊樊樊 2025-8-1 10:04
预览 [GROMACS] 能量最小化过程中,出现报错然后停止运行 attach_img huangzi 2025-8-1 1601 sobereva 2025-8-1 02:22
预览 [VMD] 应用VMD如何对PDB文件中的原子和残基重新编号? huhq 2025-7-30 6713 huhq 2025-7-31 22:28
预览 [GROMACS] 模拟水结冰怎么在固定液态水区域插入规定浓度的氯化钙分子 attach_img sarphuart 2025-7-26 2783 sarphuart 2025-7-31 20:51
[GROMACS] 模拟体系经过nvt过程之后物质糅成一团 - [阅读权限 255]attach_img huangzi 2025-7-30 13228 huangzi 2025-7-31 20:39
预览 [粗粒化/DPD] 关于使用Backward将粗粒化模型转变成全原子模型时遇到的问题 attachment xsc6 2025-7-31 4607 sobereva 2025-7-31 17:50
预览 [GROMACS] 模拟结束后对复合物进行rmsd的疑问 attach_img 王肖索 2025-7-30 2475 王肖索 2025-7-31 14:53
预览 [其它程序] 请教读取cp2k数据dpdata为0frames问题 liurui 2024-12-12 31107 hkobe 2025-7-31 14:49
预览 [GROMACS] 请问混用力场时,如何正确注意力场联用的兼容问题? 高处裹棉被 2022-3-31 65988 雷阵雨 2025-7-31 14:16
预览 [GROMACS] Linux系统安装gmxMMPBSA后终端输入gmx_MMPBSA -h指令后没有信息显示 attach_img 12313 2024-6-25 31740 :]]]]] 2025-7-31 14:11
预览 [GROMACS] 做铜板能量极小化时出现报错 attach_img ejath 2025-7-26 5623 sobereva 2025-7-31 13:20
预览 [GROMACS] 生成拓扑文件时报错 attach_img 呆宝可乐 2025-7-31 1444 sobereva 2025-7-31 13:03
预览 [Material Studio] 如何将Material_Studio的xtd文件中原子的受力信息导出 attachment zqliu 2018-9-18 812594 hxd_yi 2025-7-31 10:25
预览 [VMD] 求助:请问我用cp2k跑出的pdb结果在VMD上算配位数并不理想是为什么? attach_img 林俊杰 2025-7-30 2509 林俊杰 2025-7-30 22:02
预览 [GROMACS] pull跨膜发现膜逐渐断裂 attach_img zongshu 2025-7-29 1417 KazusaT 2025-7-30 20:04
预览 [GROMACS] 多链结构的蛋白质+化合物进行分子动力学模拟;发现RMSD剧烈波动,查看轨迹肽链断裂 attach_img wula 2025-6-5 9819 王肖索 2025-7-30 11:26
预览 [GROMACS] 关于构建纤维素Gromacs拓扑文件的问题请教 attach_img 842655799 2020-11-18 1011885 lll123 2025-7-30 10:47
预览 [GROMACS] Gromacs 200个相同分子聚集模拟报错求助 attach_img lts! 2025-7-27 5611 lts! 2025-7-29 22:26
下一页 Next page »

快速发帖 Quick post

还可输入 80 个字符
您需要登录后才可以发帖 You need to log in before you can post 登录 Login | 注册 Register

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-5-13 07:54 , Processed in 0.225694 second(s), 19 queries , Gzip On.

返回顶部 返回版块