计算化学公社

标题: GV如何将频率与相应振动模态对应？ [打印本页]

作者
Author: jing-quan63 时间: 2019-12-23 16:25
标题: GV如何将频率与相应振动模态对应？
大家好：
最近想对内部扭转进行扫描确定其能垒，但是部分扭转键无法准确判断对应哪一个振动频率，感觉耦合在一起了，请问有无办法相对准确的将二者对应？
谢谢大家！

作者
Author: 我本是个娃娃 时间: 2019-12-23 16:40
本来打算单独开贴说一下，就在此跟帖吧。以图中的情况(过渡态搜索)为例：
(, 下载次数 Times of downloads: 21)

可以看到，第一个本征值为负值，为过渡态频率。下方有本征矢量，即该负本征值的振动模式。
找出对应的A52，R15的定义，就可以知道对应的振动是否是想要的。
这个方法本来可以用在过渡态搜索过程中是否出现偏差，用在此处也不成问题。

作者
Author: sobereva 时间: 2019-12-23 18:16
本来低频正则振动模式往往就根本不与某个二面角扭转直接对应，考虑这个完全没意义

倘若是你要拿kisthelp考虑受阻转子才想这个，直接弃了
Gaussian都有现成的freq=hinderedrotor关键词，算出来考虑受阻转子的配分函数直接带入我的表格就完事了
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310（http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html）

倘若你单纯是要扫描二面角，根本不需要考虑正则模式的频率，直接扫描就完了
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)