计算化学公社

标题: 用TS法搜索丙酰氯和氯磺酸反应过渡态出现错误 [打印本页]

作者
Author: 郭德来 时间: 2020-2-3 16:18
标题: 用TS法搜索丙酰氯和氯磺酸反应过渡态出现错误
我的反应是丙酰氯和氯磺酸反应，氯磺酸掉下一个氢离子，变成氯磺酸根离子，丙酰氯变成质子化丙酰氯。

作者
Author: 阿甘 时间: 2020-2-3 23:24
1. 这初始结构不太好，建议固定一下两个氧氢距离稍微优化一下，再把优化所得结构作为TS的初始结构优化；

2. 这计算级别也太不好了，赶快看看sob老师的博文
http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html

作者
Author: sobereva 时间: 2020-2-4 04:17
写nomicro干嘛，毫无意义
iefpcm本来就是默认的，根本不需要写
直接报错原因是三个原子排成了直线，opt加cartesian。相关讨论论坛里有几十次，首页google框把报错提示放进去搜索
初猜也摆得不理想，导致最后一帧都优化成了产物。C=O干嘛拉得那么长，H和O14干嘛距离那么远。不确定怎么摆放恰当就借助柔性扫描确定，看下文
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474（http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html）

作者
Author: 郭德来 时间: 2020-2-4 11:28

sobereva 发表于 2020-2-4 04:17
写nomicro干嘛，毫无意义
iefpcm本来就是默认的，根本不需要写
直接报错原因是三个原子排成了直线，opt加 ...

谢谢老师

作者
Author: 郭德来 时间: 2020-2-4 11:28

阿甘发表于 2020-2-3 23:24
1. 这初始结构不太好，建议固定一下两个氧氢距离稍微优化一下，再把优化所得结构作为TS的初始结构优化；

...

谢谢你的意见

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2020-2-4 23:05
这初猜O..H..O摆成直线更合理。且与质子成键的更有可能显然是羰基氧上的p孤对，又不是酶反应搞定向质子化什么的，现在直接摆到pi*上去干嘛？

作者
Author: 郭德来 时间: 2020-2-5 10:36

liyuanhe211 发表于 2020-2-4 23:05
这初猜O..H..O摆成直线更合理。且与质子成键的更有可能显然是羰基氧上的p孤对，又不是酶反应搞定向质子化什 ...

对啊，我搞蒙了，谢谢

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