计算化学公社

标题: 基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格细节咨询 [打印本页]

作者
Author: 糖糖糖豆9988 时间: 2021-12-3 18:02
标题: 基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格细节咨询
新人问题可能很低级，希望大家不要嫌弃。看了老师发的计算速率常数的表格，想请问①计算透射系数的虚频是过渡态的带负号的频率，但是仍然带入正值频率？②如果使用thermo计算热力学数据，旋转对称数总是1，不需要像在kisthelp中设置？③最后多问一下，通过gview设置计算的method，那些下拉列表中没有的是不是要自己导入呢？谢谢各位老师耐心回答。

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-4 01:51
1 显然是。表格里默认值就是正的
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310（http://bbs.keinsci.com/thread-2350-1-1.html）

2 “使用thermo计算热力学数据”语义不明
我只知道Shermo
使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据
http://sobereva.com/552（http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html）

http://sobereva.com/310写得很明白了
(, 下载次数 Times of downloads: 10)

3
Q：为什么强烈不建议用GaussView的Calculate - Calculation setup界面产生输入文件？
A：这个界面纯粹是给外行人用的，非常弱，设计得也颇差。很多常用的理论方法如M06-2X、PBE0在里面都没法直接选，非常常用的def2系列基组在里面也没法用，用混合基组也很麻烦，Gaussian的大量功能靠这个界面根本用不了。纯粹靠利用此界面，至多只能使用Gaussian全部功能的1/4。而且Gaussian的关键词非常容易写，是所有量子化学程序里最简单的，用这个界面创建输入文件完全多此一举，远不如自己手写关键词快捷方便。内行人几乎没有用这个界面创建输入文件的，总是依赖于这个界面的初学者也永远不可能脱菜。内行Gaussian用户都只是靠GaussView用来创建和编辑结构，之后保存成gjf文件，自己用文本编辑器打开并手写关键词，然后提交给Gaussian计算。适合使用Calculation setup界面产生输入文件的情况也就是用QST2、QST3方法找过渡态的情况，由于这类任务的输入文件格式比较麻烦，所以才适合直接靠这个界面得到输入文件。PS：北京科音（www.keinsci.com）的量子化学培训里除了QST2、QST3外，都一律不用Calculation setup界面创建输入文件。我写的所有博文也一律不考虑读者用Calculation setup创建输入文件的情况。

作者
Author: 糖糖糖豆9988 时间: 2021-12-4 08:39

sobereva 发表于 2021-12-4 01:51
1 显然是。表格里默认值就是正的
基于过渡态理论计算反应速率常数的Excel表格
http://sobereva.com/310（ ...

谢谢老师的耐心回复。shermo，非常抱歉我的拼写疏忽误导大家了。

作者
Author: 糖糖糖豆9988 时间: 2021-12-4 08:56

糖糖糖豆9988 发表于 2021-12-4 08:39
谢谢老师的耐心回复。shermo，非常抱歉我的拼写疏忽误导大家了。

老师，再请教您一下。您在“使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数”这篇介绍中计算甲烷氢抽取反应的速率常数时，那个过渡态我用相同的计算等级M062x做了IRC，但是高斯一直报错2070，请问您知道原因吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2021-12-24 03:02

糖糖糖豆9988 发表于 2021-12-4 08:56
老师，再请教您一下。您在“使用KiSThelP结合Gaussian基于过渡态理论计算反应速率常数”这篇介绍中计算甲 ...

提问Gaussian问题的注意事项；Gaussian FAQ
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=4829

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)