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标题: 分享材料方向的滑稽计算 [打印本页]
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Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-20 21:57
标题: 分享材料方向的滑稽计算
本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-11-26 01:23 编辑

如题，分享一下日常看到的高IF paper的滑稽计算。这种文章并不罕见，审稿人通常是实验对口方向，估计不懂计算。这世界是个巨大的草台班子。
非常幽默的计算，使我大跌眼镜，迷惑行为大赏后续看到别的会继续连载


1. 奇奇怪怪，张冠李戴
期刊：Advanced Materials    IF 26.8
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/ysXvpYa4of6jXJedblXcmA
doi.org/10.1002/adma.202514735    通讯作者：上交杨旭东、王涛
题目 Electrostatically Enhanced Self-Assembled Monolayers Anchoring for Scalable and Stable Inverted Perovskite Solar Cells
静电势的色彩轴对不上，不知道从哪里粘贴复制的，逻辑清奇。把小小的静电势做成了别人看不懂的样子。我寻思不懂计算也能看出来这颜色不对，难不成是色盲？
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2. 指鹿为马，指LU为LO，槽多无口
期刊：Advanced Functional Materials    IF 19.0
DOI: 10.1002/adfm.202521431  通讯：苏州大学杨新波&协鑫
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/-q4_gWx_uMuOWXN5M2j1Lw
题目Steric-Complementary Synergistic Strategy for High-Efficiency Monolithic Perovskite/Silicon Tandem Solar Cells
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图里计算的是限制性闭壳层。相关知识参考：正确地认识分子的能隙(gap)、HOMO和LUMO http://sobereva.com/543  用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用 http://sobereva.com/448
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3. 谁偷了石墨烯的色散校正？
期刊：Nature Energy   IF 60.1   通讯：大连理工大学王宇迪&史彦涛
https://doi.org/10.1038/s41560-025-01893-8   
题目Graphene oxide doping of the hole injection layer enables 23.6% efficiency in perovskite solar cells with carbon electrodes
微信公众号在线预览 https://mp.weixin.qq.com/s/Tk-hE5zKl7mgClcwliwv1w
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参考：18碳环（cyclo[18]carbon）与石墨烯的相互作用：基于簇模型的研究一例 http://sobereva.com/615
谈谈量子化学研究中什么时候用B3LYP泛函优化几何结构是适当的  http://sobereva.com/557
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4. 谁偷了基组的极化函数？
期刊：Angew. Chem. Int. Ed.  IF 17.0   通讯作者：苏州大学李耀文
doi.org/10.1002/anie.202521774     题目Reversible Thermally Driven Phenyl Torsion in Self-Assembled Monolayers Releases Strain for Heat-Resilient Inverted Perovskite Solar Cells
谈谈量子化学中基组的选择 http://sobereva.com/336
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5. 谁偷了膦酸的氢？
期刊：Advanced Functional Materials    IF 19.0
DOI: 10.1002/adfm.202501561   题目Enhanced Buried Selective Contacts via Dual-Sided Passivation for Efficient and Stable Perovskite Solar Cells
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6. 离奇消失的结合能单位
期刊：Nature Photonics  IF 32.9   通讯作者：南开大学陈永胜院士&刘永胜
https://doi.org/10.1038/s41566-025-01797-9  
题目Spontaneous 2D perovskite formation at the buried interface of perovskite solar cells enhances crystallization uniformity and defect passivation
微信公众号在线预览https://mp.weixin.qq.com/s/dpR5sbXNSeFcwbJ4ecS3IQ
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作者
Author: rugals    时间: 2025-11-20 23:28
旗下子刊有把标题单词拼错的
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-21 13:23
rugals 发表于 2025-11-20 23:28
旗下子刊有把标题单词拼错的

好好笑，好离谱，欢迎分享。不过AM子刊也就那样。甚至Nature子刊也有计算有问题的
作者
Author: wangnan2256    时间: 2025-11-24 16:17
实验的文章大部分要么是找代算做的，要么是实验组里面做计算的学生算的，恐怕找计算组合作的都很少，而且计算组接合作的学生大概率也是博一博二的学生，很难要求他们思考多细致多全面，另外，很难要求这些实验组的学生在既没有人指导又要做实验加上给别人做计算的情况下使用完全正确的流程和方法去计算，而且实验的文章也很难让编辑专门找做计算的审稿人去审稿。其次就是这些文章的计算部分并不重要，要么是机理上实验很难证明，要么是放计算好看一些，一般不是文章的重点。挂名的老师估计也不知道计算流程和方法是不是合理，一般情况下只关注结果，只能说大家都错了，但是又不知道该怪谁。当然，故意编造数据，知假不报的不在此类情况。
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-25 20:44
wangnan2256 发表于 2025-11-24 16:17
实验的文章大部分要么是找代算做的，要么是实验组里面做计算的学生算的，恐怕找计算组合作的都很少，而且计 ...

你说得对，材料领域真的很多这样的计算，我每天都能看到这种抽象计算，令人发笑
作者
Author: Accelerator    时间: 2025-11-27 13:58
记得有篇Nature Energy用绝对能量比较两个不同组成的吸附结构的稳定性，宣称某物质的绝对能量比另一分子低了几十个Hartree，稳定性更高。已经不记得是那篇了。
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-27 14:02
Accelerator 发表于 2025-11-27 13:58
记得有篇Nature Energy用绝对能量比较两个不同组成的吸附结构的稳定性，宣称某物质的绝对能量比另一分子低 ...

谢谢分享。好惊悚的文字，让人大跌眼镜
作者
Author: beefly    时间: 2025-11-27 17:49
我见到的一个奇葩例子。上海交大的作者用MCSCF计算单电子体系：氢分子离子（H2+）。这不是杀鸡用牛刀，而是用核武器灭蚊子。

Dissociation of H2+ into selected electronic states in strong laser fields
Xin-Yuan You and Feng He
Phys. Rev. A 89, 063405, 2014
https://journals.aps.org/pra/abstract/10.1103/PhysRevA.89.063405
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-27 21:57
beefly 发表于 2025-11-27 17:49
我见到的一个奇葩例子。上海交大的作者用MCSCF计算单电子体系：氢分子离子（H2+）。这不是杀鸡用牛刀，而是 ...

谢谢分享，这简直太难绷了
作者
Author: rugals    时间: 2025-11-28 11:01
beefly 发表于 2025-11-27 17:49
我见到的一个奇葩例子。上海交大的作者用MCSCF计算单电子体系：氢分子离子（H2+）。这不是杀鸡用牛刀，而是 ...

整活意义更明显，会用多组态的选手一般也都知道什么情况可以用
作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-11-28 11:39
逛咱这论坛灌水区的人终归有限，建议像http://bbs.keinsci.com/thread-52582-1-1.html提到的那样，写好英文的评论去PubPeer发（注册匿名用户即可，搜索doi号找到文章对应页面，评完记得输入作者邮箱）。我在http://bbs.keinsci.com/thread-56984-1-1.html三楼也谈到了个被PubPeer锐评的JACS文。

在PubPeer搜索DFT能见识到不为人所知的角落里的奇葩，比如multiwfn做的同一张NCI图在十几篇文章的不同体系复用啊，上千K温度的AIMD啊，放射性元素的钙钛矿材料啊，极低配位数表面铜原子啊，相同Pt0.5Ni0.5合金表面不同平移量作为不同体系啊，等等……
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2025-11-28 15:54
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-11-28 11:39
逛咱这论坛灌水区的人终归有限，建议像http://bbs.keinsci.com/thread-52582-1-1.html提到的那样，写好英文 ...

谢谢分享。感觉你发的这些比我看到的更难绷
作者
Author: dou032    时间: 2025-12-5 16:44
那能怎么办，咱又不懂，数据可能还是代分析的，又得发文章，一起高呼，李姐万岁
作者
Author: Graphite    时间: 2025-12-7 16:03
如果看一些偏工程口带点化学的，做分子模拟，建模有一半都根本不合理。还在用十几年前、二十多年亲啊各方面都不成熟的时候的路数去算。
比较逆天的，就几千几万原子体系，普通有机物做经典动力学，还玩粗粒化，粗到十几个原子算一个珠子，氟代烃链跟普通烃用一样的参数。整个体系就剩二三种、三四种珠子了，这种模拟跟玩磁力球、摆弄球棍教具又有啥区别。
自己不会嘛找人算也可以理解，但是因为说不清楚需求、对整个微观图景了解的不清楚，久而久之会计算的见到了也习惯性推脱。最后流转到某个相关的学生、计算组萌新算、底层商业代算。到这里做实验的做计算的都磨得没心气了/落到两边做事的都是两眼发懵的/心知肚明那点勾当，最后出了个潦草糊弄的结果。
作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2025-12-27 14:16
根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿材料竟也能当孤立分子用Gaussian 09计算，期待哪位热心群众上传个全文看看。
作者
Author: AxiEJohn    时间: 2025-12-27 15:43
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-12-27 14:16
根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿 ...

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作者
Author: LPOwenChan    时间: 2025-12-27 17:06
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-12-27 14:16
根据https://doi.org/10.1002/slct.202500161这篇理论计算文章的摘要，一个非整数计量比的混合氧化物钙钛矿 ...

粗略地看了下，承包了我今年的笑点：
    1. 把钙钛矿氧化物LaMn0.4Fe0.6O3作为孤立体系来计算，实际计算中是按照Table4中的LaMn3Fe5O12来计算的，不明觉厉；
    2. 用了B3LYP和PBE泛函来计算，并且还强调是Restricted方法，计算结果对于过渡金属离子来说估计是毫无意义的；
    3. Table5中直接将HOMO-LUMO Gap当作是Band Gap，算出来了-0.012eV这种金属体系才会有的数值，但是引用的实验文献却说是“宽禁带半导体”；
    4. Figure2和Table5中的La的Mulliken电荷为+3.6，La会有这种”价态“吗？
    5. 计算了这个”分子“的偶极矩与由气相频率导出的热容和熵，这真的有任何意义吗？
    6. 煞有介事地给出了这个计算级别下的IR，作者真的知道自己在干什么吗...?
其他一些相当”有意思“的细节：
    1. 经典GaussView直出；
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    2. 似乎也是GaussView直出；
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    3. 绝对是Excel的柱状图绘图直出，连色彩序列都是默认的。
(, 下载次数 Times of downloads: 12)
其他估计还有很多笑点，但是实在不想浪费时间去细看了...
结论1: 写文章的人和审文章的人至少有一方不是人类；
结论2: 原来我不太相信AI能取代一部分人的工作，现在我相信了；
结论3: 仔细看完这篇文章能不笑的人应该可以确诊抑郁症了。
以上。
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作者
Author: 不想飞的猫头鹰    时间: 2026-1-2 19:07
https://doi.org/10.1002/adma.202301398 作者声称用GROMACS进行了COMPASS力场的计算
https://doi.org/10.1002/adma.202512960 作者声称用VASP进行了B3LYP def2-TZVP的计算
作者
Author: lindaiyu    时间: 2026-3-14 10:29
真的难崩啊，发的都还是化学优质期刊呢
作者
Author: Observer-Aya    时间: 2026-3-14 14:23
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-11-28 11:39
逛咱这论坛灌水区的人终归有限，建议像http://bbs.keinsci.com/thread-52582-1-1.html提到的那样，写好英文 ...

老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计算量太大放弃了
作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2026-3-14 19:24
Observer-Aya 发表于 2026-3-14 14:23
老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计 ...

好吓人的计算量，拿GFN1-xTB没准能行，DFT做不动吧
高温AIMD不是说一定不行，我个人理解是看物理意义。需要有理由用高温，不能无端设定。这个文章做的东西我也不懂，不好评价。如果他的物理模型不是设定在高温，或者对应实际应用一般是常温，那这个说不通。
比如我在我的研究中，为了研究两个有机小分子的热稳定性，拿ORCA做了高温AIMD，看共价键裂解。这种通常符合物理意义。或者CP2K研究某些有机物高温热解
作者
Author: Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2026-3-14 21:27
Observer-Aya 发表于 2026-3-14 14:23
老师请问做上千K温度的AIMD有什么问题吗，我一度打算用CP2K做个一千多个原子的973K的AIMD来着，后来因计 ...

熔盐或者熔融金属之类的体系热浴控温做一两千K温度的AIMD当然还是符合实际的，另外质谱（参见http://bbs.keinsci.com/thread-20479-1-1.html提到的Grimme文章）之类高能量、非热平衡的体系也可以有更高的温度。（但是像http://bbs.keinsci.com/thread-53811-1-1.html最后的表格那样强行把常温量化计算所得反应速率外推到近万K的行为就比较可疑了，这种等离子体似的极端温度下连电子是否还与原子核相互作用、Born-Oppenheimer近似是否成立都不好说的。）

我说的那篇文章是理论计算了假想的“某某原子掺杂的某某纳米体系吸附某某小分子”体系，打算用AIMD说明体系不容易受热自发分解的，此时还跑出一两千K的轨迹且没有展示完整结构截图就非常离谱了。或者也很有可能那几条曲线是别的物理量但图例被误标成了温度……
作者
Author: Observer-Aya    时间: 2026-3-15 15:12
SharkYYX2025 发表于 2026-3-14 19:24
好吓人的计算量，拿GFN1-xTB没准能行，DFT做不动吧
高温AIMD不是说一定不行，我个人理解是看物理意义。 ...

我们是做熔盐腐蚀的实验组，我本来打算用castep算个一百多个原子体系来研究腐蚀扩散行为的，但合作的指导老师告诉我至少得上千原子而且cp2k最多效率提三倍根本没法算，算了也不一定有想要的结果，最后就放弃了
作者
Author: wzkchem5    时间: 2026-3-16 09:27
Observer-Aya 发表于 2026-3-15 15:12
我们是做熔盐腐蚀的实验组，我本来打算用castep算个一百多个原子体系来研究腐蚀扩散行为的，但合作的指导 ...

这种情况还有一个问题，就是实验上在秒级以上，甚至天级的时间尺度上观察到的腐蚀，计算在ps时间尺度上很可能完全观察不到，甚至腐蚀一个原子都看不到。又不好盲目大幅提高模拟温度来加速腐蚀，那样主要的腐蚀机理可能就变了
作者
Author: cyh时代    时间: 2026-3-23 00:04
之前有人找我代算，就要这种等值面图，不明白有什么意义，这种图用VMD或者Chemcraft不好嘛，真的把话说得让人听不懂，让人听不明白，就以为自己很牛，很神，其实对于懂计算的，如同小丑

作者
Author: SharkYYX2025    时间: 2026-3-24 23:08
cyh时代 发表于 2026-3-23 00:04
之前有人找我代算，就要这种等值面图，不明白有什么意义，这种图用VMD或者Chemcraft不好嘛，真的把话说得让 ...

哈哈哈哈，他意图故弄玄虚，实际上成了内行人的乐子
作者
Author: J.Liu    时间: 2026-3-30 22:32
这么看来，PBE算弱相互作用不加D3矫正的都算比较强的了
作者
Author: hjlyyc0999    时间: yesterday 21:10
一般实验的审稿人也不太看计算，就这样过去啦



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