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柔性扫描寻找过渡态问题?

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发布时间: 2021-3-19 09:37

正文摘要:

请问老师,尝试用柔性扫描的方式寻找过渡态,将优化好的成键的平衡结构进行柔性扫描,结果呈一个上升的曲线,这种是什么原因导致的?谢谢!

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wzkchem5 发表于 Post on 2021-3-19 20:12:57
北大-陶豫 发表于 2021-3-19 15:01
给你这几个建议:
(1)为了节约计算量,可以只拿二氢菲核心部分计算,外面那些基团都删掉。算好之后的结 ...

这种体系应该得光照才能关环吧,不然热力学驱动力不足
sobereva 发表于 Post on 2021-3-19 18:38:38
拿HF/3-21G做计算毫无意义,仔细看
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

当前扫描涉及到把键拉断,对于DFT计算必须考虑对称破缺,仔细看里面扫描共价键的例子
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html

当前情况有极大概率那个C-C键断裂本身就没有过渡态。
fwz3888 发表于 Post on 2021-3-19 16:55:23
如果扫描过程中,显示的几何结构变化与构想的反应方式是一致的,可能说明这个反应没有过渡态。
北大-陶豫 发表于 Post on 2021-3-19 15:01:40
给你这几个建议:
(1)为了节约计算量,可以只拿二氢菲核心部分计算,外面那些基团都删掉。算好之后的结构再加上外面那些基团。甚至只拿一个环己二烯计算也是可以的。
(2)环己二烯的关环是对旋吧,你这个目测像是顺旋?顺旋的话是对称性禁阻的。不懂的话复习一下周环反应和前线轨道理论。

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