帖子里明确写明了

一开始载入的文件只要含有中性苯酚优化后的结构即可，其它格式如pdb/fch/gjf/mol/mol2等也都可以

“算不出来”这种描述完全没有提供任何有效信息。理解不了这么提问的人是怎么想的

什么叫算不出来，你这个表述太模糊了
是直接报错无法得到结果，还是结果不符合预期
结果是什么样的，怎么不符合预期
稍微说得再清楚一些

影响因素十分之多：假设你的输入文件等完全没问题还有以下情况：
1.高斯版本一样吗，这个影响不大，但也应考虑
2.溶剂模型一样吗，同时影响最后的能量与你想对照的福井函数与双描述符值
3.初猜结构会影响优化结构，同时影响最后的能量与你想对照的福井函数与双描述符值
最后，跟xyz没关系，并且完全对上论文数据没啥意义，你没法确定他做的结构中间到底有没有问题，你只要保证自己算的结构是无虚频+波函数稳定，计算级别+溶剂模型等正确即可。关于数值误差，参考博文http://sobereva.com/88
然后，从chemdraw里画出来的建议先用xtb预优化一下，4核机子优化不用几分钟，就不用太考虑初猜太离谱。参考博文：
将 Gaussian 与 Grimme 的 xtb 程序联用搜索过渡态、产生 IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）