喵星大佬 发表于 2021-12-23 12:25
讲道理第二个方法更好用

这不是要unload一部分就比较麻烦嘛

snljty 发表于 2021-12-22 21:48
SCF不收敛就看上面博文去解决SCF不收敛的问题，都跟你提到三次了。.bashrc不要把所有配置都写在一起，很 ...

讲道理第二个方法更好用

snljty 发表于 2021-12-22 21:48
SCF不收敛就看上面博文去解决SCF不收敛的问题，都跟你提到三次了。.bashrc不要把所有配置都写在一起，很 ...

按照那篇博文的也正在排除，还没排除完。。。
关于bashrc，我用最简单的吧，现在刚学习，还搞不定复杂的。。。多谢了！

avatar_man 发表于 2021-12-22 21:40
另外，还有一个问题，按照sob老师的帖子，安装xtb之后，编辑~/.bashrc，发现之前高斯文件也在这个里面， ...

SCF不收敛就看上面博文去解决SCF不收敛的问题，都跟你提到三次了。.bashrc不要把所有配置都写在一起，很容易冲突。最简单(但绝不是最方便)的方式是把所有的都注释掉，用哪个去掉哪个注释，然后重新登录，用完了再注释掉，再重新登录。稍微方便一些的方法是写一堆shell脚本，用哪个source哪个，然后下次重新退出再登录。最方便的方法是用Environment Modules。如果不知道.bashrc是做什么的，建议先学一天Linux基础。

snljty 发表于 2021-12-21 20:25
上面给你的博文链接认真看。另外B3LYP也不是很适合过渡金属。

另外，还有一个问题，按照sob老师的帖子，安装xtb之后，编辑~/.bashrc，发现之前高斯文件也在这个里面，我直接在这个文件后面加上sob老师让写的语句之后，gaussian运行不了了，请问我哪里是操作错误了吗？谢谢

snljty 发表于 2021-12-21 20:25
上面给你的博文链接认真看。另外B3LYP也不是很适合过渡金属。

你好，谢谢，按照sob老师和您的建议，用xtb优化了，也收敛了，请问之后得到的结构能作为初猜继续用dft进行优化和单点计算吗？会不会还是不收敛？我需要对比类似的其他的结构。谢谢

snljty 发表于 2021-12-21 20:25
上面给你的博文链接认真看。另外B3LYP也不是很适合过渡金属。

好的，谢谢啦！

avatar_man 发表于 2021-12-21 19:15
刚才用B3LYP/6-31G*也跑了一遍，一样的报错，还是不能收敛

上面给你的博文链接认真看。另外B3LYP也不是很适合过渡金属。

sobereva 发表于 2021-12-21 18:30
带过渡金属的体系通常不建议用半经验方法优化，要用半经验层面的就用GFN-xTB，对过渡金属体系远比半经验 ...

好的，我再试试，

snljty 发表于 2021-12-21 12:53
后面写着很清楚了，自洽场不收敛。看卢老师博文《解决SCF不收敛问题的方法》http://sobereva.com/61。
此 ...

刚才用B3LYP/6-31G*也跑了一遍，一样的报错，还是不能收敛

avatar_man 发表于 2021-12-21 14:22
收到，谢谢！ 我试一下dft， 因为原子比较多，原本想着先用pm6预优化下，然后再用dft，这样节省时间。

带过渡金属的体系通常不建议用半经验方法优化，要用半经验层面的就用GFN-xTB，对过渡金属体系远比半经验方法可靠得多
看下文文末PM7和GFN-xTB的对比
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）

收到，谢谢！ 我试一下dft， 因为原子比较多，原本想着先用pm6预优化下，然后再用dft，这样节省时间。

后面写着很清楚了，自洽场不收敛。看卢老师博文《解决SCF不收敛问题的方法》http://sobereva.com/61。
此体系完全不适用PM6。用PM7或者PM6D3等带色散校正的方法都会好一些。xtb的GFN2大概率会更好。
200个原子，有个主流的服务器直接拿DFT优化没问题，不需要用半经验。