peixing 发表于 2022-6-11 19:14 根本不存在“将生成的.chk文件导入到脚本中获得RESP电荷” 明明你提供含有结构信息的文件，诸如pdb，脚本直接就自动调用Gaussian和Multiwfn做一条龙服务产生RESP电荷了 一个字一个字好好看博文，别自己瞎猜，写得没法更清楚，例子都给得明明白白 计算RESP原子电荷的超级懒人脚本（一行命令就算出结果） http://sobereva.com/476（http://bbs.keinsci.com/thread-12858-1-1.html） |
牧生 发表于 2022-6-13 13:34 电荷跟我的有些不一样，这是啥原因呢？ |
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本帖最后由 牧生 于 2022-6-13 14:24 编辑 像极了以前懵懂入门的我，来让我用更通俗的语言来解释。 计算RESP电荷，参考这个帖子安装orcahttp://bbs.keinsci.com/thread-11697-1-1.html 具体步骤是： ①先参照教程下载安装opemmpi4.1.1 https://www.open-mpi.org/，然后在home目录下，按ctrl+h，把隐藏文件显示出来，鼠标双击.bashrc，然后把以下两行复制进去，红色字体替换为你实际的opemmpi4.1.1路径 export PATH=$PATH:/sob/openmpi411/bin export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/sob/openmpi411/lib ②安装orca502，下载shared和.tar.xz字样的ORCA包，解压，并在.bashrc里面添加 (红色字体替换为实际解压的路径，orca的安装，有点类似win下的“绿色”软件，只需要下载压缩包，然后解压，把路径添加到bash里面，以保证在每个目录下都可以调用。) export PATH=$PATH:/sob/orca410 export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/sob/orca410 alias orca='/sob/orca410/orca' 计算RESP电荷，只需要一个命令即可，对于碳酸根之类的原子数极少的体系，只需要1~2分钟就能算好 http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html 此时，你已经可以得到一个.chg文件了 我已经算好的itp 
CO3-2-.itp
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NO-.itp
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peixing 发表于 2022-6-11 17:49 哪看不懂具体问，写得已经超级明白了。我看看到底是怎么个“看了几个小时也没看明白” “拓扑电荷为0”莫名其妙， 根本没有什么“拓扑电荷”的概念 |
sobereva 发表于 2022-6-11 16:55 抱歉老师，acpype计算拓扑文件报错能解决吗？sobtop计算出的拓扑电荷为0，然后看用Multiwfn懒人脚本计算，看了几个小时也没看明白 |
peixing 发表于 2022-6-11 16:18 google搜索报错提示，<10秒钟找到答案 简单到如探囊取物般的linux使用问题没必要在这里问 |
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本帖最后由 牧生 于 2022-6-10 18:58 编辑 这里有个傻瓜软件可以解决你的问题 http://sobereva.com/soft/Sobtop |
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