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一个小分子Gaussian优化后为什么多了一个键啊,我应该优化后用Gview删掉吗?

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发布时间: 2023-12-2 16:42

正文摘要:

求助:刚接触量子化学,一个小分子优化后为什么多了一个键啊,就是氧原子和氢原子之间,我应该优化后用Gview删掉吗

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sobereva 发表于 Post on 2023-12-3 00:26:37
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “Gaussian/Gview” 改了,并且扣5eV作为惩罚。下次直接删帖+禁言

刚接触量子化学的过于初级的问题不要直接发主贴,去本版置顶的简单量子化学问题答疑专帖http://bbs.keinsci.com/thread-33965-1-1.html里通过回帖方式问
zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-2 20:28:10
linguotai 发表于 2023-12-2 20:16
.out打开没有问题,.chk打开的是多了一个键

那显示多出来的键没有意义,仔细阅读3L推荐的博文就行。
linguotai 发表于 Post on 2023-12-2 20:16:21
zjxitcc 发表于 2023-12-2 19:54
你打开的是chk/fchk/out/log哪个文件?这个O..H距离是多少?

.out打开没有问题,.chk打开的是多了一个键
linguotai 发表于 Post on 2023-12-2 20:15:32
牧生 发表于 2023-12-2 18:25
初始结构中,这两个原子靠的有点近,导致优化后显示成键。结果大概率是不可用的,

解决办法:优化前把这 ...

谢谢!我试试再算一次
linguotai 发表于 Post on 2023-12-2 20:14:55
Mechem 发表于 2023-12-2 19:29
gview通过原子间的几何距离判断成键,显示出的键不一定有意义,不用管它。
参考此文。http://sobereva.com ...

谢谢!我仔细看一下这个
zjxitcc 发表于 Post on 2023-12-2 19:54:32
你打开的是chk/fchk/out/log哪个文件?这个O..H距离是多少?
Mechem 发表于 Post on 2023-12-2 19:29:21
gview通过原子间的几何距离判断成键,显示出的键不一定有意义,不用管它。
参考此文。http://sobereva.com/414http://bbs.keinsci.com/thread-9840-1-1.html
牧生 发表于 Post on 2023-12-2 18:25:22
初始结构中,这两个原子靠的有点近,导致优化后显示成键。结果大概率是不可用的,

解决办法:优化前把这两个原子拖远一点。

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