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楼主 Author: sobereva
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[VMD] 在VMD中计算RMSD衡量两个结构间的差异以及叠合两个结构

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发表于 Post on 2023-10-4 12:22:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-3 14:12
可以通过距离矩阵对比差异
molclus的isostat比较结构差异的时候就是基于距离矩阵对比的

是不是比较距离矩阵的特征值就够了?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-4 14:31:34 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2023-10-4 12:22
是不是比较距离矩阵的特征值就够了?

这是一个办法,也可以把距离值按从大到小排序成为矢量,比较两个矢量的差异,molclus的isostat比较结构相似性的时候就是这么做的
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发表于 Post on 2023-10-4 16:54:33 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-10-4 14:31
这是一个办法,也可以把距离值按从大到小排序成为矢量,比较两个矢量的差异,molclus的isostat比较结构相 ...

明白啦,谢谢!

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