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[Amber] 关于ambertools并行的问题

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楼主
我是18核的机器,最近意识到我的每个sander跑起来都是一核有难 众核围观
请问没有amber的conda安装的ambertools是否可以并行运行
还是并行需要下源码编译(根本下不下来 太慢)
还是需要购买amber才可以
谢谢各位老师


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发表于 Post on 2019-10-22 22:43:15 | 只看该作者 Only view this author
可以并行,具体请看http://bbs.keinsci.com/thread-311-1-1.html

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发表于 Post on 2019-10-23 01:40:08 | 只看该作者 Only view this author
对于目前最新的ambertools19,通过conda安装的只支持串行。并行必须自己编译
免费的Ambertools里的sander(自己编译的方式),以及收费的PMEMD都可以并行,PMEMD的好处是支持GPU加速
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-23 08:16:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-23 01:40
对于目前最新的ambertools19,通过conda安装的只支持串行。并行必须自己编译
免费的Ambertools里的sander ...

好的,谢谢社长。

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