计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5825|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 分子间多质子转移势能面扫面求助

[复制链接 Copy URL]

136

帖子

0

威望

1202

eV
积分
1338

Level 4 (黑子)

老师您好,我想做分子间多质子转移,涉及到质子转移先后的问题,请问老师像下图这篇文章中分别对两个氢键扫面,但是协同扫描应该怎么扫呢?还是通过找过渡态把两个质子同时摆好位置,优化过渡态在跑IRC?

202109221601405402..png (204.54 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

202109221601405402..png

4290

帖子

4

威望

9558

eV
积分
13928

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2021-9-22 16:13:26 | 只看该作者 Only view this author
若能找到过渡态,应使用IRC路径,早期的Gaussian软件里没有TDDFT解析二阶导数,找过渡态、做振动分析较难,现在不一样了。

若最终找不到过渡态、确定没有过渡态,可以考虑两个变量协同扫描,例子见《一种用Gaussian 16中的GIC功能实现同时扫描多个坐标的方法
自动做多参考态计算的程序MOKIT

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125204

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2021-9-23 06:24:30 | 只看该作者 Only view this author
通过Gaussian 16的GIC可以实现,下文有例子
详谈使用Gaussian做势能面扫描
http://sobereva.com/474http://bbs.keinsci.com/thread-12660-1-1.html

另外,如果确实是协同的,根本没必要扫描去研究,直接找出来协同转移的过渡态,跑个IRC就完了。
用柔性扫描算ESIPT/ESDPT问题是TDDFT没解析Hessian的年代的勉强凑合用的做法,如今已经过时了,G16用户没必要再效仿。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

154

帖子

0

威望

606

eV
积分
760

禁止发言

4#
发表于 Post on 2021-9-25 07:27:05 | 只看该作者 Only view this author
提示: 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-27 07:26 , Processed in 0.169592 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list