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[综合讨论] 请问 对于平面结构的芳香性该如何计算?

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请问,1、基于VASP优化后的结构,得到簇结构后,还需要进一步的用Gaussian进行结构优化吗?
2、对于二维有机结构来说,边界用氢饱和,可以用软件的自动补氢吗,这样有的H原子就不在同一平面了。
需要手动补氢,使其在同一平面吗?

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发表于 Post on 2022-5-26 16:36:58 | 只看该作者 Only view this author
一般情况下,H原子对芳香性没有贡献。H没有P轨道。

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发表于 Post on 2022-5-26 17:19:26 | 只看该作者 Only view this author
补完氢后固定重原子,做限制性优化优化一下氢的位置。

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发表于 Post on 2022-5-26 20:23:00 | 只看该作者 Only view this author
参考下文计算簇模型的过程
18碳环(cyclo[18]carbon)与石墨烯的相互作用:基于簇模型的研究一例
http://sobereva.com/615http://bbs.keinsci.com/thread-25306-1-1.html

优化氢并得到波函数文件之后,就可以像分子体系一样,用Multiwfn照常做芳香性分析
衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/176
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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