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[xtb] 使用gaussian-xtb接口gau_xtb出现问题

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gaussian为G16-A.03;xtb为6.6.1;gau_xtb为1.0.1
试运行接口自带的示例TS.gjf时出现以下报错:
External calculation of energy, first and second derivatives.
Running external command "./xtb.sh R"
         input file       "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EIn"
         output file      "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EOu"
         message file     "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EMs"
         fchk file        "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EFC"
         mat. el file     "/home/a/g16/scratch/Gau-123180.EUF"
Failed to open output file from external program.
Error termination via Lnk1e in /home/a/g16/l402.exe


在scratch文件夹中确实只找到Gau-123180.EIn。请问大家该如何解决?

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发表于 Post on 2024-2-27 20:34:15 | 只看该作者 Only view this author
最可能的是 xTB 版本太新了,格式早就不匹配

xTB 6.61 是 2023年8月发布的
gau_xtb 1.01 版是 2020 年发布的,Latest version:1.0.1 (Release date: 2020-Jul-5)

社长之前就抱怨过 xTB 格式经常变的问题,很可能 gau_xtb 已经不能正常联用新版的 xTB 了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-27 23:10:56 | 只看该作者 Only view this author
乐平 发表于 2024-2-27 20:34
最可能的是 xTB 版本太新了,格式早就不匹配

xTB 6.61 是 2023年8月发布的

原来如此,谢谢!

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发表于 Post on 2024-2-28 06:19:33 | 只看该作者 Only view this author
实测通过此接口,G16 C.02结合xtb 6.6.1没有任何问题
仔细照着博文的用法描述检查,搞不清楚就调试脚本
将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html

博文写明了
注:经常有人问怎么用本文提供的接口联用不成功,还怀疑是本文的接口不支持较新版本的xtb。在此明确说明,本文的接口没任何问题,至少令G16 C.01结合xtb 6.5.1运行都没问题。遇到跑自己的任务失败时,起码先把本文提供的例子重复一遍,死活不成功的话,在读懂接口脚本的内容基础上,让脚本输出一些中间信息(比如脚本里用ls命令显示当前目录下的文件都有哪些、用cp命令将临时产生的文件复制出来然后人工进行检查),总能搞明白原因。另外也不要用一些稀奇古怪的运行环境。


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