关于温度与能量的讨论

clvn · 发表于 Post on 2017-2-27 22:34:59

那请教您的ΔG是怎么算的呢？
直接自由能之差相减吗？

kevin · 发表于 Post on 2017-2-28 08:44:33

clvn 发表于 2017-2-27 22:34
那请教您的ΔG是怎么算的呢？
直接自由能之差相减吗？

对，自由基A+自由基B-反应物AB

珊珊来迟 · 发表于 Post on 2017-4-18 16:16:53

请问楼主在计算不同温度下的△G和△H时是要在各自温度下重新优化反应物，过渡态分子的结构和做单点么？

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-18 20:26:22

珊珊来迟发表于 2017-4-18 16:16
请问楼主在计算不同温度下的△G和△H时是要在各自温度下重新优化反应物，过渡态分子的结构和做单点么？

结构与温度完全无关，不需要不同温度下优化

kevin · 发表于 Post on 2017-4-19 08:38:42

珊珊来迟发表于 2017-4-18 16:16
请问楼主在计算不同温度下的△G和△H时是要在各自温度下重新优化反应物，过渡态分子的结构和做单点么？

结构优化好了，再算freq，加上temperature=xxx (单位是K) 可以得到热力学的校正量，或者，如果你保存了chk文件，可以利用freqchk工具计算任意温度下的焓和吉布斯自由能

sophieding · 发表于 Post on 2020-10-15 10:46:08

kevin 发表于 2017-2-24 10:29
sob老师，这是我们以前发的一篇文章，所用的能量均是298.15 K和1 atm下的焓值。
在我们计算的反应中，包 ...

楼主，请问后面这部分判断反应路径的文章发表了么？可提供题目或链接么？最近涉及的工作跟您这边反应路径推断有些相似，想学习一下~

sophieding · 发表于 Post on 2020-10-19 16:02:59

sobereva 发表于 2017-2-24 13:25
算BDE应当用焓，但是比较反应难易，应当用自由能垒

请问Sob老师，如果一个物质是由醚键连接构成，其结构如A-O-B。计算目的与楼主一样，采用反应能垒图判断反应路径的可能性。若在A-O均裂为两个自由基，请问在作图时，采用的能量是自由能么？首先，如(A•)是采用中低能级的基组和泛函先算热力学校正量+高精度的单点能，最后，ΔG=(A•)+(•O-B)-(A-O-B)?

sobereva · 发表于 Post on 2020-10-21 12:16:07

sophieding 发表于 2020-10-19 16:02
请问Sob老师，如果一个物质是由醚键连接构成，其结构如A-O-B。计算目的与楼主一样，采用反应能垒图判断反 ...

是

无聊挂机 · 发表于 Post on 2020-10-21 17:35:56

sobereva 发表于 2017-2-24 14:39
不是BDE用自由能去算，BDE从定义上就必须得用焓来算。只不过讨论解离时候应当用自由能变来考察，这和计算 ...

请问我想计算一个溶剂中的置换反应A+B→C+D（标准大气压，25度）的自由能，请问这样对不对：
G校正——opt+freq得到的thermal corrections to gibbs free energy
E单点能——在优化好的结构上计算单点能
Gsolv——加入溶剂模型SMD后opt+freq得到的Electronic and thermal free energy
Ggas——去掉SMD后opt+freq得到的Electronic and thermal free energy
G=G校正+E单点-Gsolv+Ggas

snljty · 发表于 Post on 2020-10-21 17:56:45

无聊挂机发表于 2020-10-21 17:35
请问我想计算一个溶剂中的置换反应A+B→C+D（标准大气压，25度）的自由能，请问这样对不对：
G校正——o ...

看卢老师博文
《谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算》
http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html
你最后一行公式有问题，拟合时候用的后两部分的溶解自由能实际是单点能的差，即优化后的结构用M05-2X/6-31G*在SMD和真空中单点能的差。
顺便以下卢老师的博文也可以看一下。
《谈谈谐振频率校正因子》
http://sobereva.com/221
《使用Shermo结合量子化学程序方便地计算分子的各种热力学数据》
http://bbs.keinsci.com/thread-17494-1-1.html

csust_wyy · 发表于 Post on 2020-12-7 15:34:52

kevin 发表于 2017-2-27 22:32
这个我也不会，只会根据k=(kBT/h)exp(−ΔG/RT)，算特性温度下的k值

你好，请教一下，这个反应温度是如何设置的吗，gaussian里面默认了298k，但是我设置t=400时，算出来的能量变化是一样的，不知道是哪出了问题。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2020-12-7 16:37:53

csust_wyy 发表于 2020-12-7 15:34
你好，请教一下，这个反应温度是如何设置的吗，gaussian里面默认了298k，但是我设置t=400时，算出来的能 ...

http://sobereva.com/423
仔细看这篇文章，如果有不懂的再来问，并且说清楚具体哪里不懂

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[综合交流] 关于温度与能量的讨论

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