第16届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！（2025年5月3日至6日）

sobereva

第16届北京科音分子动力学与GROMACS培训班获得圆满成功！

2025年5月7日

北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）连同北京科韵科技发展中心于2025年5月3日至6日在北京冠京饭店成功举办了“第16届北京科音分子动力学与GROMACS培训班”，本培训由北京科音自然科学研究中心主任卢天（http://www.keinsci.com/members/Tian_Lu.shtml）讲授。本次培训同北京科音一直以来的培训一样，在十分热烈的掌声中圆满、顺利结束。本届培训已经是北京自然科学研究中心举办的第64次培训。从2015年起，北京科音开始举办的各种质量极高且费用良心的计算化学培训在我国计算化学领域内获得了非常好的口碑和很高的关注度，累计参加人数上万人，欢迎查看历届培训的回顾和学员发表的参后感想：http://bbs.keinsci.com/forum-43-1.html。

参加本次培训的学员共320多人。由于场地空间有限无法容纳所有学员，其中270多名最早提交报名表的学员被安排到现场参加，其余报名较晚或不便到现场的学员通过快递寄送印有培训用的全部近1700页幻灯片的非常详细的讲义+下载相关电子资料+听全程现场录音方式学习，也有很不错的效果。

•本次培训的学员有来自全国各地高校的，如：北大、清华、北师大、北科大、国科大、中科大、国防科大、西交大、华中科大、北理工、川大、华南理工、菏泽医学专科学校、浙大、石河子大学、上交大、山大、北航、兰大、同济、南大、宁波诺丁汉大学、中国矿业大学、复旦、天大、海南大学、哈工大，等等。
•本次培训的学员也有很多来自研究院所的，如：中科院长春应化所/分子植物科学卓越创新中心/福建物构所/赣江创新研究院/过程工程研究所/化学所/青海盐湖所/山西煤炭化学所/生态环境研究中心/长春应化所/天津工业生物技术所/遗传与发育生物学所/海洋所/深圳先进技术研究院/上海技术物理所/微电子所/烟台海岸带研究所/生物物理所、中国农业科学院生物技术研究所、中山中科药物创新研究院、中国煤炭科学技术研究院、季华实验室、北京市糖尿病研究所、中石化南京化工研究院，等等。
•本次培训的学员还有来自大陆以外的高校的，包括：纽约州立大学布法罗分校、布朗大学、乌特勒支大学、香港城市大学、香港理工大学、谢菲尔德大学、奥塔哥大学。
•本次培训有一些学员来自与材料、生物和药物有关的企业单位和医院，包括：InnoLux (群創光電)、瀚海量子科技、微共聚新材料、瑞合亿橙生物科技、灵蛛实验室前沿科技、衍微科技、迪美生物技术、粒影生物科技、宁夏瑞泰科技、康龙化成北京新药技术、青岛博奥谷、安序源成生物科技、华硼中子科技、联光元和、牛津大学(苏州)科技有限公司。
•还有学员来自医院相关机构，如：天津市肿瘤医院、深圳市眼科医院、中国医学科学院北京协和医学院、军事医学研究院、重庆医科大学附属儿童医院、深圳市中西医结合医院，等等。

北京科音的培训一直以来都以信息量极大、信息密度极高而著称。本届四天共32课时的培训安排得极其紧凑，内容丰富，强度非常大，每天上午3个小时+下午5个小时的课程中连一次课间休息时间都没有，为了尽可能多讲，每天下午实际下课时间还比预定的多一刻钟以上。由于培训的信息量实在太大导致在4天的现场培训中不可能全讲完，因此我们还向学员提供了多达约10个小时的补充视频讲解剩余内容，相当于“第5天”的课程。本次培训中由讲授者卢老师精心制作、经历届不断改进和扩充的幻灯片总量多达近1700页，相对于上一届的变化见培训报名页面http://www.keinsci.com/workshop/16KGMX。培训发给了学员印有所有这些幻灯片的讲义，幻灯片上的内容极尽详细，在课上卢老师还即兴添加了很多额外内容，争取令学员能学到更多，并且尽力把幻灯片上的内容解释得易于理解，以令学员能理解透彻、印象深刻。

在十分紧密的四天的现场培训结束后，卢老师紧接着又在培训专用的QQ群里花了大量时间非常认真、详细、耐心解答了学员们在听课中产生的各种疑问以及自己研究当中遇到的各种问题，有问必答。本次培训的专用QQ群会在培训结束后的8天后解散，此后学员们的问题还会由卢老师继续在计算化学公社论坛（http://bbs.keinsci.com）和专门交流计算化学的人气巨高、专业性极强的共计一万多人的思想家公社QQ群（http://sobereva.com/QQrule.html）中进行无限期的解答。并且本培训的学员可以按照http://sobereva.com/QQVIP.html免费申请公社QQ群的VIP头衔，从而得到卢老师的远比普通成员优先级高得多的答疑。

北京科音分子动力学与GROMACS培训班简介：培训讲授内容的详细介绍参见http://www.keinsci.com/KGMX。此培训既非常详细讲授分子动力学的各种相关的理论知识、深入全面介绍GROMACS程序的使用，也详解VMD、Packmol以及许多卢老师自编的大量相关脚本和程序的使用（如Sobtop、Multiwfn、ba2r、genmixmem）。此培训既适合分子动力学初学者，使他们回去立刻能上手开展研究，也适合已有多年研究经验的分子动力学研究者查缺补漏、获得更多模拟技巧、掌握更多类型体系的模拟方法。本培训特别注重知识的系统性、全面性、完整性，考虑到不同类型体系、不同问题模拟的要点和流程差异较大，本培训把常见的模拟体系和常见的研究问题几乎全部囊括，一一进行了细致的讲解和演示、给出了大量例子，并且传授了诸多相关研究经验和技巧。学员在充分领悟所讲内容后稍加变通、举一反三，就能对于各种实际情况应对自如，不仅会跑模拟还知道怎么进行深入的分析。北京科音分子动力学与GROMACS培训班不仅对于GROMACS使用者是极为宝贵的学习机会，AMBER、NAMD、Lammps等其它分子动力学模拟程序的使用者的水平在此次课程中也能得到很大提高，因为相关模拟理论、各种问题模拟的背景知识、分析方法、可视化程序的使用在很大程度上都是共通的。对于未来要参加“北京科音CP2K第一性原理培训班”（http://www.keinsci.com/KFP）以及“北京科音高级量子化学培训班”（http://www.keinsci.com/KAQC）从中学习从头算动力学（AIMD）或第一性原理动力学（FPMD）的学员来说，本培训给他们提供了不可或缺的动力学方面的理论基础以及分析和可视化方面的关键性背景知识。

“北京科音分子动力学与GROMACS培训班”每年都会开办2次，从而不断令更多科研工作者能顺利踏入分子动力学研究的大门、提高分子动力学研究水平，推动我国计算化学事业的整体进步。本届培训的讲义、录音、相关电子文件和补充视频可以联系北京科音官方购买，详见http://www.keinsci.com/workshop.html页面。下一届（第17届）本系列培训预计于2025年第四季度举办。另外，将于2025年5月24-27日举办的第23届北京科音初级量子化学培训班已于4月25日开始了报名，培训详情和报名方式见http://www.keinsci.com/workshop/23KEQC。这是初学者从头一次性真正完整、系统性学习量子化学计算，从而能快速上手实际研究的非常难得的机会，能够令迈入量子化学研究大门的过程中少走无数弯路，欢迎参加！

北京科音未来的培训计划参见北京科音官网http://www.keinsci.com首页的“科研预告”一栏，各种培训介绍参见科音官网的“科研培训”栏目。微信用户建议关注“北京科音”微信公众号以接收最新培训动态、最新培训报名预告，以避免错过重要培训。北京科音培训的各种常见问题参见《北京科音办的培训班FAQ》（http://www.keinsci.com/FAQ.html）。

本次培训的现场照片：

培训中卢老师的讲解使学员们受益很多。在培训最后一天结束后，有大量学员向卢老师索取签名。

Llight

内容又细又多，全是干货，一天8小时一点不舍得走神。连续四天，简直是多巴胺狂飙！培训4天，我自己光听都超负荷到嗓子不舒服了，真不知sob老师又讲又备课是怎么做到的。真希望能一直培训个十天半个月的。。。

dlg

这次培训知识量非常庞大，让我受益匪浅，内容设计得非常系统，从基础理论到实际操作，层层递进，讲解清晰易懂。卢老师专业知识扎实，结合实际案例深入浅出地分析，让我对分子动力学的核心概念和应用场景有了深刻的理解。通过演示和动手操作软件，将理论知识转化为实际技能，这种学习方式非常高效。此外，培训的组织也非常贴心，资料准备充分，还有专门的答疑，解决了学习过程中遇到的许多疑惑。整个培训过程既充实又愉快，非常感谢卢老师的辛勤付出。

小马仙人

作为一个分子动力学小白，一次偶然的机会得知了这个消息来北京参加培训。虽然获得知识的过程很痛苦，但是秉着来都来了的心态，还是逼迫自己学完了四天的内容，配合回来后的实操，能够慢慢体会到老师上课教授内容的扎实，能够做到循序渐进。最后，非常感谢sob老师的辛勤付出.

国小药

参加本次培训之前，已经做分子动力学模拟一年多了，但仍感觉所获良多。先前做动力学模拟可能只是会运行命令，并不理解这些命令运行后，程序到底是怎么处理我的体系，听完卢老师详细的讲解，也算是慢慢理解了。分子力场，拓扑文件，模拟运行参数等等，老师非常系统的带领我们认识这些比较抽象的东西，尤其是对于我们这些非计算化学领域的人，但又需要这项技术来帮助我们的研究。总体而言，四天高强度的培训下来可能还有点迷迷糊糊，但讲义的详细程度足够帮助我们回去慢慢品味分子动力学模拟的有趣之处。非常值得推荐！！！

Minierha

  组内分子动力学模拟的开山弟子，自己学起来处处碰壁，开始时走的弯路可以说是九曲十八弯。后来关注到sob老师创建的计算化学公社论坛，在里面看到了几乎自己遇到的所有关于分子动力学模拟问题的讨论，以及sob老师和各路大神非常非常非常专业的解答，可谓是干货满满，信息量巨大，每一条回答所涉及的知识点深挖下去都是一个庞大的体系。
  其实我的方向属于试验＋模拟，因此并不是特别需要像sob老师和各路计算领域大神那样完备且专业的计算模拟知识。但是，见贤思齐，想要在sob老师的论坛以及思想家公社群聊和老师们讨论就必须对模拟知识有一定理解，因此报名了此次培训班。这次培训班sob老师所安排的课程从理论到实践，一环扣一环，内容非常非常充实，不走神听完真的是受益匪浅，大开眼界。有这么好的机会，我不想只体验一次。因此，我也报名了下次的初级量化班，希望能再一次领略到sob老师关于计算领域的独到见解，从量子化学角度再次完善自己的模拟手段与分析方法，期待！！！

全能阿洲

sob老师是如何做的一天连续讲这么久还不怎么喝水，完全不上wc的，我在下面只是听就喝了2瓶水，一天至少也要上两次wc，憋到最后生怕错过知识，不得不说这种敬业的精神很令人敬佩呀

sobereva

全能阿洲 发表于 2025-5-8 15:14
sob老师是如何做的一天连续讲这么久还不怎么喝水，完全不上wc的，我在下面只是听就喝了2瓶水，一天至少也要 ...

我早上和中午都刻意少喝水，免得讲课时憋着
我耐力好，不喝水对我来说不是什么事，尤其是专注讲课的时候不会介意口渴

Kaichang-Zhao

作为分子动学模拟的小白，认为这次培训真的很全面，各个知识细节都讲清楚了，讲义的内容也很全，直接参加再复习就能构建出一个体系，感觉都不怎么需要再去乱七八糟的网页上学习了，而且培训中有很多经验类的技巧，不是能轻易在外面能学习到的！

bling莹莹子

作为分子动力学模拟的小白，在前期自学过程中走了很多很多的弯路，花费了大量的精力，最终却跑不出理想的结果。经过这几天的培训把自己前面遇到的问题全都解决了，sob老师把分子动力学模拟的知识讲的细致入微，虽然一些原理性的东西在实际模拟操作过程中不会用到，但是自己没有对基础知识系统的理解连自己模拟的对错都模棱两可。这几天都会自己改文件了，自己就能分析和解决一些问题，真心建议大家做相关研究跟着sob老师系统学习下，这几天下来真的物超所值！！！

yuzj41d

研究生期间开始做纯计算，小导是实验转的，只会一些高斯，然后我做的又是第一性原理方向，早就想参加卢老师的量子化学初级班和第一性原理相关课程的培训了，可惜当时未能说服老师，反而给我报了一个更贵没什么用的oniom的课程，收获应该没法比，现在马上要去读博了，趁这次机会来系统学下分子动力学模拟，感觉光VMD详细的使用和出图都值回票价了，更不用说这么多系统的MD知识，收获太多了，后续要慢慢啃，慢慢消化。讲义也太棒了！

xiaowei2022

可惜研一没时间来参加，等研二有机会可以自费参加。本科做的均相，用的高斯，研究生在用CP2K和lammps研究多相体系，不知道卢老师会不会讲一讲最近很火的机器学习势函数跑分子动力学模拟？希望明年还会有。

Uus/pMeC6H4-/キ

xiaowei2022 发表于 2025-6-26 14:44
可惜研一没时间来参加，等研二有机会可以自费参加。本科做的均相，用的高斯，研究生在用CP2K和lammps研究多 ...

巧了，这次培训开始前也有人问过类似问题，我还在这里简单说了些看法。

MLP和经典分子力场在研究范式上差别还是挺明显的，目前这方面的概况可以看看这帖与这帖，其中第二个帖子提到的DeepModelling有详细的教程文档可供自学。

sobereva

xiaowei2022 发表于 2025-6-26 14:44
可惜研一没时间来参加，等研二有机会可以自费参加。本科做的均相，用的高斯，研究生在用CP2K和lammps研究多 ...

不会在此培训里讲，本来此培训的内容就超级超级超级多，现场4天时间都根本讲不完，来不及讲的主题都是补充视频形式提供。就算有也是未来高级分子动力学培训班或第一性原理扩展班的内容
ML势有极大的局限性，不要盲目跟风，最终在完全不必要的折腾上白耽误很多时间。费时费力折腾ML之前，先想清楚到底自己是否真的需要ML、是否要研究的问题真的是靠目前成熟主流的研究手段解决不了的。而且弄ML之前，必须先有十分充分的传统研究方法的理论背景知识和程序使用知识，这都是本培训里极为详细讲的，不具备这些前提就跟风鼓捣ML都是瞎搞。

xiaowei2022

sobereva 发表于 2025-6-26 17:33
不会在此培训里讲，本来此培训的内容就超级超级超级多，现场4天时间都根本讲不完，来不及讲的主题都是补 ...

了解了，非常感谢！