原子间距很远，键级很小，应该看作是两个片段，还是一个分子

曼竹w · 发表于 Post on 2017-12-24 20:30:28

说错了就是算相互作用能，整体的单点能减去片段的单点能，那这样的话，形变能需要考虑吗，，

sobereva · 发表于 Post on 2017-12-24 20:55:03

曼竹w 发表于 2017-12-24 20:30
说错了就是算相互作用能，整体的单点能减去片段的单点能，那这样的话，形变能需要考虑吗，，

看你目的
跟实验比较需要考虑，纯粹研究特定结构下的结合能不用考虑
和主贴没直接关系的问题请到简单量化答疑专贴里问

曼竹w · 发表于 Post on 2017-12-25 11:01:19

好的，谢谢sob老师

曼竹w · 发表于 Post on 2017-12-27 16:16:21

sob老师，我还有点疑问，1、比如那个计算一个金属离子和一个小分子的结合能，直接画好这个结构，优化后，分别抠出金属离子和小分子的坐标计算一个单点能就行吗？
2、那比如金属结合以后如何计算这个小分子结合金属后的变形能

3、计算结合能的时候是在小分子优化完后在这个模型上加上金属原子，还是初始构型就画好呢

sobereva · 发表于 Post on 2017-12-27 19:46:58

曼竹w 发表于 2017-12-27 16:16
sob老师，我还有点疑问，1、比如那个计算一个金属离子和一个小分子的结合能，直接画好这个结构，优化后，分 ...

1 是
2 孤立状态下优化的结构和复合物中抠出来的结构能量求差
3 无所谓。前者稍微合理些。如果小分子有多种可能的构象、金属有多个可能的结合位点，应当都进行考虑，取能量最低的状态来算结合能。

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[波函数分析求助] 原子间距很远，键级很小，应该看作是两个片段，还是一个分子