计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 90|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 酶团簇限制性优化后,做振动分析确定结构有无虚频和ZPE校正量是否需要取消冻结?

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

131

eV
积分
139

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,我的研究体系是从酶中挖出的一个团簇,冻结αC后进行限制性优化,想做振动分析,①通过无虚频确定结构是合理的,优化是成功的,②低水平基组计算ZPE的校正量用于后续单点能计算,
此种情况下,我该直接使用原本限制性优化好的结构去做freq,还是用限制性优化好的结构取消冻结后,进行freq?
参考sob社长 在Gaussian中做限制性优化的方法 提到的"另外,只要是做了冻结,那么优化肯定不会收敛到全局空间极小点,而只能够收敛到扣除被冻结变量的子空间当中的极小点去,因此用这样的结构再做振动分析,往往会出现虚频,这是非常正常的。"那我做完限制性优化,直接用结构做优化往往会出现虚频,那我如何通过freq无虚频确定结构为合理的优化成功的呢?


请各位老师指教

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112492

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-10-8 03:57:42 | 只看该作者 Only view this author
用限制性优化好的结构带着和优化相同的冻结设置做freq
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

8

帖子

0

威望

131

eV
积分
139

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-8 04:25:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-8 03:57
用限制性优化好的结构带着和优化相同的冻结设置做freq

好的,多谢sob老师的回答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 00:53 , Processed in 0.171124 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list