计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10290|回复 Reply: 14
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] 求教:多次碰到使用orca算单点能时报error in MDCI ,内存问题还是磁盘问题?

[复制链接 Copy URL]

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 aaq2800 于 2020-10-19 10:19 编辑

闭壳层的体系单点能,每个核分配3-4G内存,就足够。
计算开壳层的体系单点能,按社长的帖子,用gauss生成波函数,然后计算,多次碰到error in MDCI ,就如这个帖子的情况。
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... dertype=1&tid=19599

只好降低核心数,增加每个核分配的内存,现在只开了3个核,每个核30G内存。即使这样还是不行。体系大小跟闭壳一样的,内存怎么差这么多?
系统盘的空间100G,ORCA装在D盘,空间500G,计算过程中,临时文件最多时不到100G。
请问下这是怎么原因?是内存不够还是磁盘不够?


上传了输出文件,大神们给看看怎么回事。闭壳层也碰到过error in MDCI 的情况,都是减少一下核心数,增加内存,就解决了,碰上这个开壳层,核心数一降再降,依然解决不了问题

aa.out

158.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 27

4289

帖子

4

威望

9534

eV
积分
13903

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2020-10-15 15:45:03 | 只看该作者 Only view this author
error in MDCI的上面 可能还有 报错信息,不能一概而论。具体问题具体分析。如果你找不到报错信息,可以上传输出文件。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

1万

帖子

0

威望

9851

eV
积分
22085

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-10-15 17:19:55 | 只看该作者 Only view this author
对于开壳层体系,ORCA会从你的UHF轨道构造QRO轨道,相当于近似的ROHF轨道,然后单占轨道不做局域化。这时因为单占轨道离域在整个体系上,cutoff变得非常低效,所以计算量陡增。
如果确定临时文件自始至终没有占满硬盘,那就不是硬盘的问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 08:44:44 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-15 15:45
error in MDCI的上面 可能还有 报错信息,不能一概而论。具体问题具体分析。如果你找不到报错信息,可以上 ...

上传了输出文件,求大神给过过目

1万

帖子

0

威望

9851

eV
积分
22085

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2020-10-17 09:54:16 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2020-10-17 08:44
上传了输出文件,求大神给过过目

Error in PAL_ftell,是硬盘问题。
你的输入文件也在D盘吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 09:59:30 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-17 09:54
Error in PAL_ftell,是硬盘问题。
你的输入文件也在D盘吗?

是的,安装在D盘,输入文件,输入文件都orca文件夹里

4289

帖子

4

威望

9534

eV
积分
13903

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

7#
发表于 Post on 2020-10-17 10:05:09 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2020-10-17 08:44
上传了输出文件,求大神给过过目

目前看不出啥,我只能先给2点建议
(1)应该写UHF而非UKS;
(2)去掉miniprint可以输出更多内容,看是否出现更有用的信息。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-17 10:06:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 aaq2800 于 2020-10-17 10:28 编辑
zjxitcc 发表于 2020-10-17 10:05
目前看不出啥,我只能先给2点建议
(1)应该写UHF而非UKS;
(2)去掉miniprint可以输出更多内容,看是 ...

UKS是按社长的例子写的。我马上测试一下,测试了一下。UKF不认得

4289

帖子

4

威望

9534

eV
积分
13903

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

9#
发表于 Post on 2020-10-17 10:43:57 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2020-10-17 10:06
UKS是按社长的例子写的。我马上测试一下,测试了一下。UKF不认得

你写了错别字了吧,是UHF
自动做多参考态计算的程序MOKIT

227

帖子

0

威望

2800

eV
积分
3027

Level 5 (御坂)

10#
发表于 Post on 2020-10-17 16:26:33 | 只看该作者 Only view this author
若是磁盘问题,通常磁盘会保持在写满状态。内存问题的话,因为闪崩,结果文件看不出任何错误,磁盘不会写满

128

帖子

1

威望

429

eV
积分
577

Level 4 (黑子)

11#
发表于 Post on 2020-10-17 16:50:28 | 只看该作者 Only view this author
不对啊,为什么要用Windows做计算

看起来这不像是服务器的配置啊,难道是个人电脑(误)
先开任务管理器看看内存以及计算过程中的可用内存吧

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-19 10:21:35 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-17 10:05
目前看不出啥,我只能先给2点建议
(1)应该写UHF而非UKS;
(2)去掉miniprint可以输出更多内容,看是 ...

去掉miniprint,重新上传了输出文件,大神看看到底哪里的问题。另外把每核的内存提高到了40G,依然出错。

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-19 10:23:51 | 只看该作者 Only view this author
DoorBell 发表于 2020-10-17 16:50
不对啊,为什么要用Windows做计算

看起来这不像是服务器的配置啊,难道是个人电脑(误)

win2008的系统,128G内存,算闭壳层系统好好的,可以开到20个核,20多个原子的体系4,5个小时算完,算开壳层的不知道怎么这么困难

4289

帖子

4

威望

9534

eV
积分
13903

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

14#
发表于 Post on 2020-10-19 10:51:40 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2020-10-19 10:23
win2008的系统,128G内存,算闭壳层系统好好的,可以开到20个核,20多个原子的体系4,5个小时算完,算开 ...

感觉我上面的回复 白写了。。。不要写UKS,写UHF没看到?

要是还报相同错误的话,那你只能到ORCA官方论坛上去提问了(记得仍然用写UHF的输入输出文件,不要写UKS)。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

235

帖子

0

威望

3374

eV
积分
3609

Level 5 (御坂)

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-19 15:04:35 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-10-19 10:51
感觉我上面的回复 白写了。。。不要写UKS,写UHF没看到?

要是还报相同错误的话,那你只能到ORCA官方 ...

好的,正在测试

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 06:47 , Processed in 0.182210 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list