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计算流程:
1.使用Gaussian+orca进行过渡态搜索
参照社长的http://sobereva.com/422
orca计算参数如下
! B97-3c tightSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore 1000
%pal nprocs 16 end
! CPCM(Water) #没有隐性溶剂模型也算了
Gaussian参数如下
%chk=/home/xiu/soft/gau_orca/B97-3c/TS1.chk
%nproc=1
# opt=(nomicro,calcfc,ts,noeigen) external='./orca.sh'
TS1
-1 1
C -2.41999000 1.21827000 0.67075000
C -1.94679000 0.36239300 -0.46503000
C -1.38893800 -0.89264400 -0.22714200
N -1.19108000 -1.76941000 -1.31276500
O -1.00781600 -1.29562300 0.92379400
H -1.63157500 1.35891100 1.41902200
H -2.71119200 2.21008200 0.31621100
H -2.32996900 0.56816900 -1.45767200
H -0.37296300 -2.35157100 -1.18476300
H -1.17801500 -1.31022500 -2.21465000
C 0.14899500 1.37371300 -0.82603400
C 1.00862000 1.24054600 0.23047600
C 1.97473400 0.17276100 0.31344700
N 2.75735600 0.14463400 1.43718500
O 2.17629100 -0.67675400 -0.59445100
H 0.30433000 0.79861800 -1.72897100
H -0.43372900 2.27707500 -0.93356700
H 0.94233900 1.91646600 1.07526400
H 2.47667500 0.67616400 2.24658500
H 3.31272000 -0.68171200 1.59828700
H -3.28463400 0.80204800 1.20469800
中间还尝试了orca4、orca5和Gaussian16、09各种混合联用。
经过几轮计算,几何优化是成功了,但最终结构非常奇怪,且找不到过渡态。最终放弃!
我推测可能是我的体系是阴离子,B97-3c好像不计算弥散函数。
请各位大佬看看我是否需要加弥散?
2.单独Gaussian计算
参数如下
#P opt=(calcfc,ts,noeigen) freq ub3lyp/TZVP em=gd3bj scrf=(smd,solvent=water)
结构不变,没加弥散,几何优化成功,过渡态寻找成功。
3.单独ORCA 5.01计算
参数如下
! B3LYP D3 def2-TZVP(-f) def2/J RIJCOSX optTS freq tightSCF noautostart miniprint nopop
%maxcore 10000
%pal nprocs 16 end
! CPCM(Water)
%geom Calc_Hess true end
结构不变,没加弥散,几何优化成功(和Gaussian结构有差别,可能是参数不一样),过渡态寻找成功。
4.主要问题:
现在已经计算到60个原子左右的体系了,参数和单独使用orca5.01一样,经过非常漫长的计算,过渡态都计算成功了
因为后期要计算200个原子体系,我怕最后算不动,决定使用B97-3c泛函
我使用B3LYP D3 def2-TZVP(-f) 结算成功的结构,用B97-3c计算
最终几何优化无法收敛,SCF是收敛的,出来的结构同样很奇怪,有的体系直接跑分离了。
请问各位大佬,这是为什么呢?因为刚开始学orca,具体也不知道什么原因
如果我想使用B97-3c,这个该怎么解决,倾向于使用这个泛函,想早点计算完,毕竟不是专业做理论计算的。
如果继续使用B3LYP D3 def2-TZVP(-f) 后面的体系能否算的动,算的太慢怕是毕不了业。
再次感谢各位老师和专家给与解答,谢谢。
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