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[综合交流] OH阴离子参与的反应如何计算?

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本帖最后由 BinWang 于 2025-7-22 16:37 编辑

各位老师:
       我计算水中OH-参与的反应,反应计算结果总结如下:

A+ + OH- = AOH                     ΔG=-18.2 kcal/mol
AOH + OH-= AO -  + H2O              ΔG=-15.87 kcal/mol
A+ + OOH- = AOOH                  ΔG=-8.26 kcal/mol
AOOH + OH-= AOO -  + H2O           ΔG= -18.64kcal/mol
AOO -= BOO -                         ΔG=-7.25 kcal/mol
这些计算结果与实验严重不符,例如,将PH值矫正到7时,实验没观察到AO-或者BOO-的生成,但理论预测表明生成这两个产物的 ΔG=-15kcal/mol左右。我用的是#p  ub3lyp  nosym em=gd3  6-311G** smd(Water)溶剂模型。请问是我没加弥散函数,还是b3lyp-d3泛函不适合这类体系?或者我需要显式溶剂模型?

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202507221637256363..png

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发表于 Post on 2025-7-22 14:37:17 | 只看该作者 Only view this author
其他原因先不说,没加弥散函数 足以导致文章被内行审稿人毙了。先排除硬伤,再谈其他的。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-22 14:50:20 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-7-22 14:37
其他原因先不说,没加弥散函数 足以导致文章被内行审稿人毙了。先排除硬伤,再谈其他的。

非常感谢老师

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傻傻的木瓜

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发表于 Post on 2025-7-22 15:13:55 | 只看该作者 Only view this author
要问“B3LYP-D3泛函适不适合这类体系”的话,还得描述下代号A和B的部分的特征(闭壳层/简单开壳层,全是短周期主族元素/涉及过渡金属/涉及长周期元素,静态相关是否不强,有没有大范围共轭,等等)。此外,讨论自由能数据之前,应当先分别指出 几何优化振动分析获得热力学校正量 与 单点能(电子能量) 这两步计算的具体级别,二者不宜相同,且B3LYP不适合作为单点能计算的级别,参考http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-12773-1-1.html两篇。
√546=23.36664289109

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-22 16:38:44 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 BinWang 于 2025-7-22 16:45 编辑
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2025-7-22 15:13
要问“B3LYP-D3泛函适不适合这类体系”的话,还得描述下代号A和B的部分的特征(闭壳层/简单开壳层,全是短 ...

非常感谢老师回复,图片我已经传上去了,一个过渡金属络合物上的亚胺受到OH-的进攻。OH我已经在图中用红色框出来了。我是用6-31G(d,p)优化的结构,用6-311G(d,p)矫正电子能。溶剂效应在b3lyp-d3/6-31G(d,p)下矫正的。

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