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[新手求助] orca中优化时使用m062x/6-11g**应该怎么输入,此外怎么在orca中进行零点能校正

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各位老师同学请教下
1.在orca中优化时使用m062x/6-11g**应该怎么输入呢?手册上没有找到2.此外怎么在orca中进行零点能校正,比如在gaussian 中m062x/6-11g**的ZPE的校正因子是0.97,那么在orca中怎么校正呢?


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发表于 Post on 2018-4-28 11:54:05 | 只看该作者 Only view this author
没有叫6-11g**的基组
直接把ORCA给出的ZPE乘上这个校正因子即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-28 19:48:58 | 只看该作者 Only view this author
我打错了,是6-311g**,我在输入文件中写:
! M062X 6-311g(d,p) opt freq tightSCF pal4
%maxcore 2000
* xyz
C
N
F
省略
*
错误,M062X/6-311g(d,p)在orca中怎么输入呢?
另外,如果我想算在2atm下优化,应该怎么输入呢,gaussian我会,但是orca不会

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发表于 Post on 2018-4-28 20:12:24 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-4-28 19:48
我打错了,是6-311g**,我在输入文件中写:
! M062X 6-311g(d,p) opt freq tightSCF pal4
%maxcore 2000 ...

压力完全不影响优化结果
M062X这些meta类型的泛函在ORCA里没有二阶解析导数,所以直接写freq报错
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-29 12:48:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-28 20:12
压力完全不影响优化结果
M062X这些meta类型的泛函在ORCA里没有二阶解析导数,所以直接写freq报错

1.在gaussian中如果想得到不同校正因子下或者不同温度、不同压力下的热力学数据,是使用freqchk工具即可;但是在orca中我看了input Library,找到了关于不同温度的输入方式,但是没有找到得到不同压力下的热力学数据的方法。老师您说在orca中想得到ZPE校正后的热力学数据,可以直接乘以校正因子就行,但是不同压力下应该怎么办呢?目前还没找到解决方法。
2. M062X泛函在orca中没有二阶解析导数,我在input Library中找到了freq不适合用于meta泛函这个说明,那是不是在orca中就不能用M062X泛函进行频率分析了,只能使用这个泛函进行几何优化和单点计算,那几何优化和频率分析如果想一起做的话是不是不知道用什么泛函的时候就用B3LYP。
3.我昨天晚上9点对一个11个原子4C 1N 7F 的分子进行单点能计算,! CCSD(T)-F12/RI cc-pVDZ-F12 cc-pVDZ-F12-CABS cc-pVTZ/C tightSCF pal4  ,现在还没有计算出结果,这是为什么呢,感觉不应该这么慢啊

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发表于 Post on 2018-4-29 13:44:01 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-4-29 12:48
1.在gaussian中如果想得到不同校正因子下或者不同温度、不同压力下的热力学数据,是使用freqchk工具即可 ...

2.既然m062x没有解析频率,那肯定会有数值频率。因此应该用NumFreq关键词把。(初学ORCA,如若不对还请老师指出)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-29 20:23:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-28 20:12
压力完全不影响优化结果
M062X这些meta类型的泛函在ORCA里没有二阶解析导数,所以直接写freq报错

还有问题就是,我使用您推荐的双杂化泛函去进行单点能计算,输入:
! RI-PWPB95 D3 RIJK def2-QZVPP def2-QZVPP/JK def2-QZVPP/C grid4 tightSCF pal4
输出结果错误,如图,说不要重复关键字def2-QZVPP/JK,我没有重复啊,就是按您说的方法输入的啊,怎么会出现这种情况呢?不明白

1525004508(1).png (5.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 69)

输出文件的错误

输出文件的错误

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发表于 Post on 2018-4-29 20:49:33 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-4-29 20:23
还有问题就是,我使用您推荐的双杂化泛函去进行单点能计算,输入:
! RI-PWPB95 D3 RIJK def2-QZVPP def ...

如果是ORCA 4.0系列,是def2/JK而没有def2-QZVPP/JK

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发表于 Post on 2018-4-30 00:18:27 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-4-29 12:48
1.在gaussian中如果想得到不同校正因子下或者不同温度、不同压力下的热力学数据,是使用freqchk工具即可 ...

1 借用shermo算不同压力的热力学数据
Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序
http://sobereva.com/315

2 用数值频率可以。但远不如用高斯

3 正常
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-30 21:11:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-30 00:18
1 借用shermo算不同压力的热力学数据
Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序
http://sob ...

老师感谢的回复,如果我只是想算分子的解离能,反应焓值、势垒,那利用B3LYP/6-311G**优化几何结构的时候需要加校正D3(BJ)吗?我看您以前的文章说加D3后会在热力学数据计算上有少量改进,我只是想算BDE、势垒等,现在低水平上优化,再提高精度去计算单点能

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发表于 Post on 2018-4-30 22:28:17 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-4-30 21:11
老师感谢的回复,如果我只是想算分子的解离能,反应焓值、势垒,那利用B3LYP/6-311G**优化几何结构的时候 ...

有好处,建议加
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-1 10:58:25 | 只看该作者 Only view this author

谢谢老师耐心的解释,刚开始学习orca,在orca中输入形式是:! B3LYP/G 6-311G** D3BJ Opt Freq tightSCF pal4 就行是吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-5-1 11:08:08 | 只看该作者 Only view this author

此外,还有个问题,在orca中计算5~12原子的自由基和分子间的反应势垒、焓值等问题的时候,选择您推荐的RI-PWPB95 D3算单点,B3LYP/G 6-311G** D3BJ 优化,这个级别精度可以吧。我试了好几种方法算单点能,CCSD(T)-F12/RI 和DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ计算11原子的分子的单点能耗时太长了,可能是我电脑不行4核的,所以想着用您推荐的30~40原子的方法RI-PWPB95 D3来计算单点能,所以想问您这个级别计算10个原子甚至<10个原子的可不可以

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发表于 Post on 2018-5-1 13:22:21 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-5-1 10:58
谢谢老师耐心的解释,刚开始学习orca,在orca中输入形式是:! B3LYP/G 6-311G** D3BJ Opt Freq tightSCF ...

直接写D3,默认就是BJ阻尼
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发表于 Post on 2018-5-1 13:23:27 | 只看该作者 Only view this author
长颈鹿先森 发表于 2018-5-1 11:08
此外,还有个问题,在orca中计算5~12原子的自由基和分子间的反应势垒、焓值等问题的时候,选择您推荐的RI ...


双杂化那样用可以
CCSD(T)/cc-pVDZ-F12,即便10个原子,只有四核时耗时也是很高的,实际测试一下便知
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