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[PSI4] 两个水分子优化,PSI4能量分解后与sob老师的文章有差异,想知道问题出在哪里?

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最近,在计算水分子相互作用的时候发现,两个水分子优化后,采用sob老师帖子:使用PSI4做对称匹配微扰理论(SAPT)能量分解计算http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 15902&fromuid=25115
(出处: 计算化学公社)
中的分解方法对其进行分解,与sob老师的文章http://sobereva.com/513的结果有点出入,想问一下是哪里出了问题?sob老师文章中是-4.96kcal/mol,我算出来是-4.54kcal/mol这是图1是水分子优化后的结构 ,将这个结构坐标用PSI4进行分解;这是输入文件
;这是输出结果202302112042117060..png (283.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)







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发表于 Post on 2023-2-12 19:16:33 | 只看该作者 Only view this author
你发完贴,你看了吗??炫瞎我了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-12 19:31:49 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2023-2-12 19:16
你发完贴,你看了吗??炫瞎我了

我也不清楚是怎么回事,我看着也是绿的,我重新编辑了

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发表于 Post on 2023-2-12 21:44:42 | 只看该作者 Only view this author
注意看下文介绍的JCC文章里几何结构的优化级别
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
http://sobereva.com/513http://bbs.keinsci.com/thread-14600-1-1.html

另外,你的结构根本不是水二聚体的能量最低构型,氢键键角大得离谱。
这才是水二聚体能量最低构型


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-13 10:03:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-2-12 21:44
注意看下文介绍的JCC文章里几何结构的优化级别
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC ...

感谢sob老师的回复,我再去试试

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发表于 Post on 2023-2-13 18:44:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2023-2-13 18:49 编辑

我也算了一下那两个水分子的结合能,与文献中是完全一致的。
你只需要把文献Exploring Nature and Predicting Strength of Hydrogen Bonds-A Correlation Analysi.pdf 支撑信息中的水分子坐标复制过来,用Multiwfn生成psi4的inp文件,命名为H2O.inp,然后运行psi4 H2O.inp -n 16,半分钟后得到H2O.out文件,打开此文件就能找到如下内容

  Total HF                         -5.75525488 [mEh]      -3.61147696 [kcal/mol]     -15.11041960 [kJ/mol]
  Total SAPT0                      -9.15465127 [mEh]      -5.74463040 [kcal/mol]     -24.03553359 [kJ/mol]
  Total SAPT2                      -7.52435852 [mEh]      -4.72160626 [kcal/mol]     -19.75520058 [kJ/mol]
  Total SAPT2+                     -8.21549452 [mEh]      -5.15530064 [kcal/mol]     -21.56977789 [kJ/mol]
  Total SAPT2+(3)                  -7.82082646 [mEh]      -4.90764270 [kcal/mol]     -20.53357704 [kJ/mol]
  Total SAPT2+dMP2                 -8.30003631 [mEh]      -5.20835142 [kcal/mol]     -21.79174233 [kJ/mol]
  Total SAPT2+(3)dMP2              -7.90536825 [mEh]      -4.96069347 [kcal/mol]     -20.75554149 [kJ/mol]

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-13 21:31:25 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2023-2-13 18:44
我也算了一下那两个水分子的结合能,与文献中是完全一致的。
你只需要把文献Exploring Nature and Predict ...

嗯嗯,谢谢,主要是我还要算其他的体系,所以想要搞清楚具体的问题出在哪,这个优化方法好像对我的体系过于精准了,我现在用的DFT/6-31g(d,p)的基组优化的,结果算出来就是差很多,我想着继续提高基组,然后看大概到什么程度误差可以接受,请问,这个换成CCSD方法然后逐渐提高基组是不是好一点呢?

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发表于 Post on 2023-2-15 05:34:59 | 只看该作者 Only view this author
longwenjun 发表于 2023-2-13 21:31
嗯嗯,谢谢,主要是我还要算其他的体系,所以想要搞清楚具体的问题出在哪,这个优化方法好像对我的体系过 ...

CCSD和当前没半点关系
十几个原子体系CCSD做优化都算不动,算相互作用能又太烂(相对于CCSD(T))
优化氢键复合物再次也得B3LYP-D3(BJ)/6-311G**

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